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蜗牛pig清金虫 (小有名气)
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关于blast的一个问题 已有1人参与
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| 我想看看某个基因A在另一物种X中是否有同源基因，我先找到A然后blast比对，在结果中没有X的信息，是否就能说明A基因在物种X中没有同源基因？blast结果是否包含所有的结果？求指导！！！！！！！！谢谢大家了！ |
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各位道友，我要去昆明玩几天，回来见。
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蜗牛pig清
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4楼2015-06-01 23:21:46
jlzheng1224
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liuderong
铁杆木虫 (正式写手)
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网页版的 NCBI 的blast只显示比对的部分结果，因为如果比对结果很多的话，加载要很长时间。看两物种的同源基因，首先判断物种亲缘关系，比如水稻和小麦就比和拟南芥亲，如果亲缘关系近，就用基因做blast，如果亲缘关系远就最好翻译成蛋白再比对。比对的时候，要找到你所指的X物种的基因组或者蛋白组，最好不要用NCBI默认的数据库，因为那样做干扰信息太多，物种的同源基因会因为同源性不高而被隐去。 [ 发自手机版 http://muchong.com/3g ] |
3楼2015-06-01 21:32:12
wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
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