| 查看: 1773 | 回复: 5 | |||
[求助]
18S和 ITS两项测序结果能鉴定到种吗？如何构建系统发育树 已有2人参与
|
|
现已对筛选到的1株真菌进行18S和ITS测序，二者结果不完全一样，请问如能结合两项测序结果构建系统发育树鉴定到种吗？金币少得可怜，以后有金币了再多送，谢谢~！ 18S序列 CATACGTCGAGCTCTCTGGTGATCATGATAACTAGTCGAATCGACAGGCCTTGTGCCGGCGATGGCTCATTCAAATTTCT TCCCTATCAACTTTCGATGTTTGGGTCTTGTCCAAACATGGTGGCAACGGGTAACGGAGGGTTAGGGCTCGACCCCGGAG AAGGAGCCTGAGAAACGGCTACTACATCCAAGGAAGGCAGCAGGCGCGCAAATTACCCAATCCCGACACGGGGAGGTAGT GACAATAAATACTGATACAGGGCTCTTTTGGGTCTTGTAATCGGAATGAGTACAATTTAAATCCCTTAACGAGGAACAAT TGGAGGGCAAGTCTGGTGCCAGCAGCCGCGGTAATTCCAGCTCCAATAGCGTATATTAAAGTTGTTGTGGTTAAAAAGCT CGTAGTTGAACCTTGGGCCTGGCTGGCCGGTCCGCCTCACCGCGTGCACTGGTCCGGCCGGGCCTTTCCCTCTGCGGAAC CCCATGCCCTTCACTGGGTGTGGCGGGGAACCAGAAACCTTTTAC ITS序列 GGGTTCGGGGGCTCCTCCCAACCCATGTGACGTTACCAAACTGTTGCCTCGGCGGGGTCACGCCCCGGGTGCGTCGCAGC CCCGGAACCAGGCGCCCGCCGGAGGAACCAACCAAACTCTTTCTGTAGTCCCCTCGCGGACGTATTTCTTACAGCTCTGA GCAAAAATTCAAAATGAATCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTGGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGA TAAGTAATGTGAATTGCAGAATTCAGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCGCCAGTATTCTGGCGGGCAT GCCTGTCCGAGCGTCATTTCAACCCTCGAACCCCTCCGGGGGATCGGCGTTGGGGATCGGGACCCCTCACACGGGTGCCG GCCCCGAAATACAGTGGCGGTCTCGCCGCAGCCTCTCCTGCGCAGTAGTTTGCACAACTCGCACCGGGAGCGCGGCGCGT CCACGTCCGTAAAACACCCAACTTTCTGAAATGTTGACCTCGGATCAGGTAGGAATACCCGCTGAACTTAAGCATATCAA TAAGCGGAGGAA |
回复此楼» 猜你喜欢
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有5人回复
-
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有74人回复
-
岩土工程学报什么时候才能终审完呐
已经有4人回复
-
时间戳又变了8-15
已经有25人回复
-
2027广东省杰青
已经有6人回复
-
快农历七夕节了，轻松一下，男人悄悄话，女施主请不要进来。
已经有3人回复
-
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜？
已经有9人回复
-
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有26人回复
-
我的国基提前知道中了，可是同事的操作让我实在接受不了，怎么会有这样的人
已经有16人回复
-
有时候，自然基金真的不能太认真 （我的申报经验）
已经有12人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求教关于使用16s RDNA对细菌鉴定时，关于构建系统发育树的问题。
已经有12人回复
- 16S rDNA测序结果无法拼接疑问
已经有7人回复
- 真菌微生物怎么鉴定到种属，怎么界定跟别人筛出的不同？
已经有8人回复
- 对细菌进行测序时，测的是16S rDNA还是16S rRNA
已经有25人回复
- 关于真菌18S在NCBI上BLAST问题
已经有8人回复
- ITS1/4序列进行blast同源比对问题
已经有4人回复
- 用16S测序鉴定单一菌株的困惑
已经有15人回复
- 测序结果已出，后续如何分析，以达到菌种鉴定的目的
已经有5人回复
- 关于18s rDNA 建系统树的问题
已经有6人回复
- 26s rDNA系统发育树的构建
已经有7人回复
- 真菌ITS鉴定问题若干
已经有8人回复
- 霉菌18SrDNA鉴定，构建发育树的问题
已经有6人回复
- 求教 放线菌 16S rDNA 比对
已经有4人回复
- 土壤微生物16s rDNA 18s rDNA 抑制扩增不出来？？？？？？
已经有12人回复
- 求助呀，怎么鉴定金龟子绿僵菌
已经有7人回复
- 系统发育树中的bootstrap怎么调整？
已经有7人回复
- 鉴定细菌种（不是属）的生物学方法有哪些
已经有27人回复
- 真菌的分子鉴定
已经有11人回复
- 菌种鉴定的费用悬殊？鉴定内容却…？请教各位前辈啊。
已经有26人回复
- 建系统发育树时怎么样才能调高bootstrap值啊？送金币
已经有34人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 【求助/交流】MEGA 画系统发育树中的bootstrap values和Identity scores有什么区别？
已经有22人回复
肥猫p
木虫 (正式写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 2763.1
- 散金: 145
- 红花: 10
- 帖子: 340
- 在线: 189.3小时
- 虫号: 1709733
- 注册: 2012-03-22
- 专业: 微生物资源与分类学
2楼2014-11-13 20:39:15
肥猫p
木虫 (正式写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 2763.1
- 散金: 145
- 红花: 10
- 帖子: 340
- 在线: 189.3小时
- 虫号: 1709733
- 注册: 2012-03-22
- 专业: 微生物资源与分类学
【答案】应助回帖
|
Select seq gb|JF719288.1| Trichoderma sp. FCP3 18S ribosomal RNA gene, partial sequence 926 926 97% 0.0 99% JF719288.1 Trichoderma asperellum strain TR11 18S ribosomal RNA gene, partial sequence; internal transcribed spacer 1, 5.8S ribosomal RNA gene, and internal transcribed spacer 2, complete sequence; and 28S ribosomal RNA gene, partial sequence 1026 1026 97% 0.0 100% KC859432.1 |
3楼2014-11-13 20:43:17
肥猫p
木虫 (正式写手)
- 应助: 94 (初中生)
- 金币: 2763.1
- 散金: 145
- 红花: 10
- 帖子: 340
- 在线: 189.3小时
- 虫号: 1709733
- 注册: 2012-03-22
- 专业: 微生物资源与分类学
4楼2014-11-13 20:44:09
5楼2014-11-14 22:17:24
冼亮淀粉酶
专家顾问 (知名作家)
生物大分子降解酶
-
专家经验: +248 - MicEPI: 114
- 应助: 257 (大学生)
- 贵宾: 0.272
- 金币: 19796.7
- 散金: 1704
- 红花: 121
- 帖子: 6619
- 在线: 2793.7小时
- 虫号: 856414
- 注册: 2009-09-25
- 性别: GG
- 专业: 环境微生物学
- 管辖: 微生物
6楼2014-11-17 04:24:44
25