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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 真菌微生物怎么鉴定到种属，怎么界定跟别人筛出的不同？
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2011jonathan

禁虫 (小有名气)
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1楼 2014-09-26 14:15:09
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yunshenglmm

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2014-11-19 09:18:41
通过18srRNA测序，利用进化树分析，可以确定你的种属
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2楼2014-09-26 18:09:37
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1902194422

铁杆木虫 (小有名气)
感谢参与，应助指数 +1
dllchina: 你这是学艺不精么，真菌一般是18S和ITS结合，原核才是16S 2014-09-29 23:59:38
dllchina: 应助指数-1, 屏蔽内容, 屏蔽内容，避免误导 2014-09-30 00:00:13
本帖内容被屏蔽
3楼2014-09-27 09:55:47
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muji9908

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
laozuzunzhe: 金币+1, 鼓励应助！ 2014-11-19 09:18:56
真菌一般是ITS,18S, 28S, beta-tubulin gene. ITS最重要。 不过理化分析，形态分析都必不可少（如果要发表成新菌的话）
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4楼2014-09-29 08:40:13
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星馨1988

新虫 (初入文坛)
种属关系的鉴定就需要测序，理化性质的鉴定可以参考沈平的《微生物实验》
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5楼2014-09-29 09:44:16
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刘文瑶

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
有些丝状真菌，尤其是曲霉属，ITS序列同源性达到100%,还需要再做形态学鉴定，那样比较确切
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6楼2014-09-29 11:17:25
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2011jonathan

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
7楼2014-09-30 18:29:31
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shmilying

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 2011jonathan at 2014-09-29 22:29:31
您好，我做过ITS测序后，通过blast比对发现和别的序列同源性达到99%，是不是就意味着和我筛选的菌株不算新菌，做后续研究没有什么意义呢，还望指教，谢谢！！！...

ITS测序后，通过blast比对发现和别的序列同源性达到99%,那就说明你发现的这个菌株和已知的菌株最相似。不是新菌株。新菌株的同源性对比要小于97%才能认为是新的种。试验有无意义，看你的目的。并不是不是新菌株就没什么研究意义了，不同种属的菌株，只要你挖掘的条件适合它特殊的生长代谢机理，总是有东西可做的。建议你多看看分子方面的文章，包括新种发表的文章。。。
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何处是我的岸
8楼2014-10-12 20:23:34
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彤毋戚

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yunshenglmm at 2014-09-26 18:09:37
通过18srRNA测序，利用进化树分析，可以确定你的种属

同源性99%也能确定种吗？我做了18s和ITS,两者结果不一致要怎么破
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9楼2014-11-14 21:42:35
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