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依然自然

新虫 (小有名气)

[求助] RNA提取时,浓度4252.2,A260/280=1.99,但电泳跑不出RNA,原因是? 已有10人参与

我在提取RNA时,取样0.1g,新鲜样品现磨,用的Trizol提取法。结果RNA的浓度可以,2.0>A260/280>1.8,A260/230>2.0。但跑胶时没有RNA出现,只有点样孔很亮,和DNA Marker条带(图1)。跑胶时采用点样体系:DNA Loading Buffer、DNA Marker、Gel stain(核酸染料)各2ul,上样量2ul。跑胶条件:U=100V、I 随意,时间12min。出现问题之后,我采用大电泳槽电泳,电泳条件为:U=220V、I 随意、时间15min。结果是RNA拖尾,DNA Marker更清楚(图2)。请问这种问题可能是由于什么原因造成的?谁有好主意接下来我该做些什么测试才能找出问题和解决问题?谢谢!

RNA提取时,浓度4252.2,A260/280=1.99,但电泳跑不出RNA,原因是?
图1.jpg


RNA提取时,浓度4252.2,A260/280=1.99,但电泳跑不出RNA,原因是?-1
图2.jpg
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
依然自然(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2015-05-15 19:34:31
1.提取RNA的时候RNA的颜色有没有变深?
2.如果真是多糖多酚污染的话,听说有一种CTAB提植物RNA的方法,LZ可以去查一查。
3.其实可能最简便的解决方法就是把你现在提取样品稀释个100倍再跑个胶看看,你提的浓度那么大,随便混杂点多酚沉淀就把你点样孔给堵了,先先稀释了跑一下看看能不能跑出孔,如果实在是你RNA全给结合了话只有试一试专门的试剂盒了!~你的提取方法是没有问题的

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大家相互帮助哈
8楼2015-05-13 20:20:20
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查看全部 23 个回答

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
依然自然(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-05-15 19:33:49
加样孔很亮,应该是你的RNA中有杂蛋白污染。
2楼2015-05-13 15:43:17
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依然自然

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2015-05-13 15:43:17
加样孔很亮,应该是你的RNA中有杂蛋白污染。

我提取的植物是一种多酚多糖的,听我师姐的意思是RNA被一种蛋白或者糖类包裹着,跑不出来,但她也不知道如何改进。请问如何有效的改进我的实验?  谢谢了!
生命就如旅行。。。。所以要一直笑着
3楼2015-05-13 18:22:19
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
都没提出来,测OD有什么用

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-05-13 18:28:00
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