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秦始皇faq

铁虫 (初入文坛)

[求助] PCR条带弥散,不知道是什么原因,希望各位师兄师姐帮我看看。 已有4人参与

各位师兄师姐,我最近一直在做PCR,想同源克隆大麦——小麦,从大麦中查找的序列,然后设计的引物,模板是小麦的cdna,一般情况下跑出来得条带是弥散的。有条带的大小也和预计的不一样,预计大小在1300bp左右,看图片上的条带都超过2000bp了。
不知道哪里出现了问题,模板前些日子刚用tubling扩了一次,都是有条带的。

第二个问题:为什么第二幅图的条带都是连续的两条?我以前用小孔(10微升体系)的胶能扩出来一条1300bp的,但是换了大孔(20微升体系)的胶(为了回收)怎么就扩不出来了呢。

我用的酶是方塔高保真酶。
体系(10微升):酶                     0.2
                           引物1、引物2:各0.4
                          buffer:                5
                          dntp:                    0.2
                          水                           3.6
                          模板:                  0.1

pcr反应条件:95——3min
                     95 ——15s
                     53——15s(有条带的那张)、65——15s(以前一直没有条带弥散,所以一直升高退火温度,可是还没有。。。)
                       72——1min30s
                    72—— 5min

一共33循环。
麻烦各位老师,师兄师姐帮我看看。

PCR条带弥散,不知道是什么原因,希望各位师兄师姐帮我看看。
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PCR条带弥散,不知道是什么原因,希望各位师兄师姐帮我看看。-1
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yili_90

金虫 (正式写手)

先找循环数。29X就够了。如果没有就加高退货温度2到3度。如果还是没有,那就降低引物浓度。最好终浓度为0.2uM。如果还是没有,那就稀释模板
plummet
6楼2015-03-24 12:55:57
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