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lulufantasy

新虫 (小有名气)

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专业: 环境污染化学

[求助] 构建系统发育树

实验考察土壤中微生物群落结构的变化，构建系统发育树！具体步骤为：做DGGE后，切胶测序，测序结果在blast中查找相似序列（Ident高），下载match序列，将测得的序列和match的序列放入mega中，首先align，后面建树。建树后出现error，提示mega kimura distance incalculable
不知步骤是否有问题？步骤没错的话是哪里出了问题？对微生物实在头疼！谢谢大家了

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1楼 2015-02-07 22:08:53

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lulufantasy

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我的mega比对见下图！
band为测序结果
有名称的为blast比对后match的序列
Ident均高于90%

构建系统发育树

5EGJ}%YP3[A}VMU@FZQ1PHI.png

2楼2015-02-07 22:20:56

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