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lulufantasy

新虫 (小有名气)

[求助] 构建系统发育树

实验考察土壤中微生物群落结构的变化,构建系统发育树!具体步骤为:做DGGE后,切胶测序,测序结果在blast中查找相似序列(Ident高),下载match序列,将测得的序列和match的序列放入mega中,首先align,后面建树。建树后出现error,提示mega kimura distance incalculable
不知步骤是否有问题?步骤没错的话是哪里出了问题?对微生物实在头疼!谢谢大家了
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lulufantasy

新虫 (小有名气)

我的mega比对见下图!
band为测序结果
有名称的为blast比对后match的序列
Ident均高于90%
构建系统发育树
5EGJ}%YP3[A}VMU@FZQ1PHI.png

2楼2015-02-07 22:20:56
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