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好孩子5521

新虫 (初入文坛)

[求助] RACE死活做不出来已有4人参与

大家好,目前在做RACE,用的invitrogen试剂盒,除了高保真酶用的是pfu的,其余都是按照说明书一步步做的,反转之前测了下RNA质量,5S带有点亮,应该是RNA有些降解,但不至于什么也P不出来吧。巢式PCR也试了,1号基因的3‘端和2号基因的5’端出来了条带,已经检测过5‘是假阳性的。然后又更换了引物,还是没有结果。已经做了3个月了,恳求做过的指点下,很郁闷。
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naringenin

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

用的最贵的么,那个需要连RNA接头的那个?如果是的话,那么RNA质量决定一切,如果你的RNA有降解,那么依据那个试剂盒的原理,你的5'端根本连不上那个RNA接头,5‘race不会有任何结果!
这个试剂盒还可以。目前本实验室做出来了20个左右基因的5‘race,30多个基因的3’race。

如果不是用的最贵的,用的那个便宜的话,就是接oligodG的,那个确实不好用,比较难做,不过用于做3’race是足够了。

基本就是RNA质量决定一切。

3‘race相对来说好做些,对RNA质量要求低一些。

另如上所述,pfu酶不适合用在这里,推荐takara的LA-taq。
拿到两端后再设计引物用高保真酶做pcr,获得无变异的全长。
7楼2015-09-18 16:38:06
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