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淘气笨笨21

新虫 (初入文坛)

[求助] RACE5‘一直做不出来怎么办?

小女子最近钓一个基因保守估计在5k以上,3’做出来了,5‘进展很慢,每次都是两轮RACE才会出200-300bp片段。更换过模板,引物也换了不下20对,退火温度设计在65左右,用的66-64-62-60的touchdown程序。就是没有长片段出来。每次巢式后都有很多条带,但都很浅,而且都挨得很近,难以割胶回收,是不是不是特异性的条带啊?如何提高条带特异性,让条带又少又亮?
另外这次有好几个基因出了700-800条带,连接转化后跑菌液PCR也有700-800bp,为什么测序后比对只有质粒序列呢?

请各位高手指点迷津。不胜感激。
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wanghd2826

铁虫 (小有名气)

同求,坐等高人。
2楼2012-08-14 10:30:15
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chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
可以加入少量二甲基亚砜做下看,可以提高PCR特异性,对大部分引物有效果,楼主只有试一下看。
3楼2012-08-14 19:46:48
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woshizhufeng

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
5race本来就难做的,加入少量二甲基亚砜试一试吧,可能有效。我建议楼主更换引物吧。
4楼2012-08-15 08:46:00
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