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明月照清渠

金虫 (小有名气)

[求助] gromacs运行npt 已有1人参与

想用gromacs跑npt,为什么体系不收缩反而膨胀呢？不知是否和compressibility有关？气体的compressibility应该设为多少合适呢？

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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1楼 2014-12-12 16:42:15
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060622124

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
那就把压力加大看看趋势，如果趋势都不对，那就不对了
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2楼2014-12-13 10:46:38
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明月照清渠

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 060622124 at 2014-12-13 10:46:38
那就把压力加大看看趋势，如果趋势都不对，那就不对了

请问vpt对nve有什么影响么？如果不跑npt，直接跑nve，这样合理么？

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-12-13 13:21:45
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060622124

金虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 明月照清渠 at 2014-12-13 13:21:45
请问vpt对nve有什么影响么？如果不跑npt，直接跑nve，这样合理么？
...

一般是先跑NVT，再跑NPT吧，但是我就是直接跑的npt，这跟你的初始模型、研究对象有关系
赞一下 回复此楼
4楼2014-12-13 23:42:16
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