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vito22

新虫 (小有名气)

[求助] NdeI内切酶的保护碱基个数? 已有4人参与

近来用Thermo的NdeI,涉及加保护碱基的问题,有的人说需要加六个保护碱基,有的说七个,而根据NEB官网的提示,加三个就可以了(https://www.neb.com/tools-and-re ... nd-of-dna-fragments),请问有经验的虫友们,NdeI加几个保护碱基合适?
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lpzl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
vito22: 金币+10 2014-12-10 16:31:45
加3个保护碱基就可以了。。。我就是这么做的。
Start_everyday_with_a_new_hope,_leave_bad_memories...
2楼2014-12-09 18:32:23
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
需要加吗?我从来不加,因为根本就不需要加保护碱基。

[ 发自小木虫客户端 ]

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-12-09 18:37:44
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嘿小杨同志

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-10 20:07:54
http://wenku.baidu.com/link?url= ... NpZK_Qi8bGzg8Nm37Y_这里就有,一般来说我加了GGAATTC,但是不建议楼主选用这个酶切位点,太难切了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-12-09 19:33:17
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意萧02

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-12-10 20:08:02
加两三个够了,一般没啥影响,很多人加都没加,照样可以,所以不要太纠结这个问题,不放心就加两三个意思意思,加上去的最好跟序列能够匹配,这样结合率高点

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

5楼2014-12-10 15:42:22
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vito22

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lpzl at 2014-12-09 18:32:23
加3个保护碱基就可以了。。。我就是这么做的。

请问NdeI加3个保护碱基的酶切酶连效率如何?
6楼2014-12-10 16:34:53
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vito22

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by Neo2000 at 2014-12-09 18:37:44
需要加吗?我从来不加,因为根本就不需要加保护碱基。

不需要加保护碱基?!请问不加保护碱基是针对哪个限制酶说的,还是所有的限制酶都不用加,不加的效率如何,NdeI有没有试过呢
7楼2014-12-10 16:38:41
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vito22

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by 嘿小杨同志 at 2014-12-09 19:33:17
http://wenku.baidu.com/link?url=Ab9xn-TSbAuhyDzKIGJTcjjiJqB7_tG6fZG--eiP6ErZ-xmACJsgfJEDiKtdBsdDtRJcwHbW7RmzQONslUHRsT4INpZK_Qi8bGzg8Nm37Y_这里就有,一般来说我加了GGAATTC,但是不建议楼主选用这个酶切位 ...

谢谢,太难切了是说加了七个碱基效率依然不高吗,用得哪个公司的酶?
8楼2014-12-10 16:43:16
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vito22

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by 意萧02 at 2014-12-10 15:42:22
加两三个够了,一般没啥影响,很多人加都没加,照样可以,所以不要太纠结这个问题,不放心就加两三个意思意思,加上去的最好跟序列能够匹配,这样结合率高点

谢谢提醒,对于大多数限制酶来说,“加两三个够了”,针对NdeI也是如此么?
9楼2014-12-10 16:45:05
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嘿小杨同志

金虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by vito22 at 2014-12-10 16:43:16
谢谢,太难切了是说加了七个碱基效率依然不高吗,用得哪个公司的酶?...

takara的,这个酶效率都不高楼主慎用啊。
10楼2014-12-10 17:20:16
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