应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 酶切位点如果形成稳定的a-helix，会不会影响蛋白酶切的效率？
131/1返回列表
查看: 3255  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

todd999

木虫 (正式写手)

[交流] 酶切位点如果形成稳定的a-helix，会不会影响蛋白酶切的效率？

酶切位点如果形成稳定的a-helix，会不会影响蛋白酶切的效率？
也就是说酶切位点的二级结构对于酶的效率有无影响？

[ Last edited by silicare on 2014-5-14 at 18:29 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-04-10 12:36:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

todd999

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by lybio at 2012-04-25 15:00:45:
楼主能不能分享下cell 文献

Crystal Structures of a Formin Homology-2 Domain Reveal a Tethered Dimer Architecture
就这篇：）
赞一下(1人) 回复此楼
11楼2012-04-27 14:39:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

zhixuec

木虫 (著名写手)
★
todd999(金币+1): 谢谢参与
有影响 但不会太大的

还是可以切的

相信我~
赞一下 回复此楼
2楼2012-04-10 13:17:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

todd999

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhixuec at 2012-04-10 13:17:33:
有影响 但不会太大的

还是可以切的

相信我~

我看到一篇cell的文章，里面讲有一个linker结构域，文中使用了chymotrypsin和trypsin两种酶来切。已经知道这个linker结构域没有明显的二级结构。最后说了一句话：These sites would not be expected to be accessible to proteases if maintained in a stable helical conformation

这么说来，酶切位点不光是一级结构起作用，二级结构的影响也很大？
赞一下 回复此楼
3楼2012-04-10 13:23:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

junxiao0320

金虫 (小有名气)
★
todd999(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by todd999 at 2012-04-10 13:23:51:
我看到一篇cell的文章，里面讲有一个linker结构域，文中使用了chymotrypsin和trypsin两种酶来切。已经知道这个linker结构域没有明显的二级结构。最后说了一句话：These sites would not be expected to be acces ...

最近连接表达载体，总是切不好，是不是这个原因呢，值得考虑
赞一下 回复此楼
4楼2012-04-10 14:15:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

todd999

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by junxiao0320 at 2012-04-10 14:15:36:
最近连接表达载体，总是切不好，是不是这个原因呢，值得考虑

表达载体不是蛋白啊？
赞一下 回复此楼
5楼2012-04-10 20:45:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

米菲的旋律

木虫 (著名写手)
★ ★ ★
todd999(金币+1): 谢谢参与
zhaohq1209: 金币+2, 鼓励原创交流~ 2012-04-13 11:24:43
引用回帖:
5楼: Originally posted by todd999 at 2012-04-10 20:45:07:
表达载体不是蛋白啊？

很容易理解成为基因克隆里的酶切，hehe~

按我的理解吧，如果是蛋白折叠好之前的酶切，那可能与二级或者三级结构关系不大；
但如果，某蛋白酶的底物是已经折叠好的蛋白，那么它的识别位点肯定要受二级结构甚至三级结构影响了。

举个例子，假设某蛋白酶的识别序列是XOXO，而该序列不仅分布在分子表面位点A，也分布于包埋的疏水内部B，那么结果可能是只有A被识别，而B就是inaccessible了。
赞一下 回复此楼
6楼2012-04-12 22:27:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

todd999

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 米菲的旋律 at 2012-04-12 22:27:26:
很容易理解成为基因克隆里的酶切，hehe~

按我的理解吧，如果是蛋白折叠好之前的酶切，那可能与二级或者三级结构关系不大；
但如果，某蛋白酶的底物是已经折叠好的蛋白，那么它的识别位点肯定要受二级结构甚至 ...

对啊，感觉这个问题应该挺基础，而且经常会遇到，但是却搜不到满意的答案，奇怪。。。
赞一下 回复此楼
7楼2012-04-13 00:43:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lybio

金虫 (正式写手)
★
todd999(金币+1): 谢谢参与
做了挺多个蛋白，设计同样的蛋白酶切位点，用同一批次的蛋白酶，有的切的很好，有的效率低，有的切不动，有的乱切。乱切可以理解为有些蛋白酶专一性比较差导致，其他的可能是跟蛋白的高级结构有关
赞一下 回复此楼
8楼2012-04-25 14:57:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lybio

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhixuec at 2012-04-10 13:17:33:
有影响 但不会太大的

还是可以切的

相信我~

楼主能不能分享下这篇文献？
赞一下 回复此楼
9楼2012-04-25 15:00:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lybio

金虫 (正式写手)
楼主能不能分享下cell 文献
赞一下 回复此楼
10楼2012-04-25 15:00:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Enron

铜虫 (小有名气)
★
todd999(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
6楼: Originally posted by 米菲的旋律 at 2012-04-12 22:27:26
很容易理解成为基因克隆里的酶切，hehe~

按我的理解吧，如果是蛋白折叠好之前的酶切，那可能与二级或者三级结构关系不大；
但如果，某蛋白酶的底物是已经折叠好的蛋白，那么它的识别位点肯定要受二级结构甚至三 ...

有相关文献吗,求
赞一下 回复此楼
12楼2014-05-14 14:12:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

飞奔的大象

新虫 (小有名气)
★
todd999(金币+1): 谢谢参与
(⊙o⊙)…蛋白酶去切蛋白分子的时候，酶切位点一定是暴露在表面才可能进入活性中心的底物口袋。但是你的酶切环境直接影响了蛋白的结构，是否松散，是否可及。不然就不会有最适的PH ，最适温度，最适盐离子浓度之说了~
赞一下(1人) 回复此楼
13楼2014-06-12 18:08:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 todd999 的主题更新
131/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 13:50 by etmYJ6d2rquH
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +8 zju2000 2026-09-26 9/450 2026-09-29 13:47 by ahsoarli
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 10:26 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-29 09:59 by JzYBbHIXWSrW
[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 4/200 2026-09-29 09:49 by JzYBbHIXWSrW
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +5 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-29 09:24 by JzYBbHIXWSrW
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:42 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:34 by ZvyPK8n6Nfki
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:28 by ZvyPK8n6Nfki
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 ZYXdhzDAy9ZX 2026-09-28 3/150 2026-09-29 06:18 by ZvyPK8n6Nfki
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 tqUTOxClQUMF 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:46 by b8fCuTHqckEt
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 GDBe8tDZqE8z 2026-09-28 3/150 2026-09-28 23:12 by b8fCuTHqckEt
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 4/200 2026-09-28 22:55 by ez6fGg9abYaj
[有机交流] 同一个分子，一条来自文献，一条来自AI——不告诉你答案，你会选哪条？ +3 tianxiaoxian 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:44 by tianxiaoxian
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 5/250 2026-09-28 22:32 by ez6fGg9abYaj
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 3/150 2026-09-28 22:21 by ez6fGg9abYaj
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 6/300 2026-09-28 22:15 by ez6fGg9abYaj
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 CfXuS1rDhLYN 2026-09-28 3/150 2026-09-28 19:08 by 9lS3ad5oOymn
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 IDs3scOF0tjC 2026-09-28 4/200 2026-09-28 18:51 by 9lS3ad5oOymn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭