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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 蛋白/酶 » 基质金属蛋白酶MMP-2的酶切位点或序列
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zyl623008624

金虫 (正式写手)

[求助] 基质金属蛋白酶MMP-2的酶切位点或序列 已有2人参与

如题：哪位大神能查到基质金属蛋白酶MMP-2的酶切位点或序列，不是那种短肽的
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1楼 2014-03-26 15:13:00
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zyl623008624: 金币+5, ★有帮助 2014-03-31 10:48:48
我把该基因序列和酶切位点上传到了网盘，你下载下来看一下（页数很多，因为该基因有25k左右，很大）
http://pan.baidu.com/s/1kTK9ZyZ

授之以鱼不如授之以渔，下面是具体方法，希望对你有帮助
你在ncbi上搜索MMP-2
然后找到序列
把序列输入到bioedit上，直接就生成了所有酶切位点。
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天行健
2楼2014-03-26 16:50:31
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youlinglyw

荣誉版主 (著名写手)

一匡天下

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zyl623008624: 金币+5, ★有帮助 2014-03-31 10:48:59
简单的列一下如下，包括，限制酶切图，酶切频率
Restriction Enzyme Map:

1       ACATCTGGCGGCTGCCCTCCCTTGTTTCCGCTGCATCCAGACTTCCTCAGGCGGTGGCTGGAGGCTGCGCATCTGGGGCT   80
1       TGTAGACCGCCGACGGGAGGGAACAAAGGCGACGTAGGTCTGAAGGAGTCCGCCACCGACCTCCGACGCGTAGACCCCGA   80
                         BbvI      MnlI    BstF5I    SfaNI     BbvI     BspCNI    FspI    MwoI   
                             FokI       MspA1I           Bsu36I   MnlI   BseMII           HpyF10VI   
                                              Hpy188III          MnlI                    SfaNI   
                                                                                        BpmI   
                                                                                        Eco57MI   


Enzyme    Recognition                   frequency  Positions
__________________________________________________________________________
AarI      CACCTGCnnnn'nnnn_             5          9289, 9596, 17883, 20267, 22078
AccI      GT'mk_AC                      14         2006, 3161, 5246, 5457, 5512
                                                   5658, 5878, 5937, 7637, 10893
                                                   14335, 14637, 17214, 17854
Enzymes that cut five or fewer times

Enzyme    Recognition                   frequency  Positions
__________________________________________________________________________
AarI      CACCTGCnnnn'nnnn_             5          9289, 9596, 17883, 20267, 22078
Acc65I    G'GTAC_C                      1          19164
AfeI      AGC'GCT                       3          306, 2169, 13024
AflII     C'TTAA_G                      4          2532, 13250, 23176, 25881
AgeI      A'CCGG_T                      2          9546, 14123
AhdI      GACnn_n'nnGTC                 4          2245, 3496, 16624, 17131

Enzymes that do not cut:
_________________________________________________________
AatII, AclI, AscI, AsiSI, BcgI, BcgI, BsiWI, ClaI, FseI, NotI, PmeI, PvuI, RsrII
SalI, SfiI, SgrAI, SnaBI, SrfI, ZraI
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天行健
3楼2014-03-27 10:04:53
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zyl623008624

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-03-26 16:50:31
我把该基因序列和酶切位点上传到了网盘，你下载下来看一下（页数很多，因为该基因有25k左右，很大）
http://pan.baidu.com/s/1kTK9ZyZ

授之以鱼不如授之以渔，下面是具体方法，希望对你有帮助
你在ncbi上搜索M ...

很不错，但是我要的不是碱基的酶切位点，是这种蛋白酶切其他蛋白质时（如5型胶原）蛋白质的位点，还是很恩感谢
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4楼2014-03-27 10:30:56
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zyl623008624

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by youlinglyw at 2014-03-27 10:04:53
简单的列一下如下，包括，限制酶切图，酶切频率
Restriction Enzyme Map:

1       ACATCTGGCGGCTGCCCTCCCTTGTTTCCGCTGCATCCAGACTTCCTCAGGCGGTGGCTGGAGGCTGCGCATCTGGGGCT   80
1       TGTAGACCGCCGACGGGAGGGAA ...

抱歉啊，我要的不是碱基的位点，是蛋白酶切蛋白质的位点
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5楼2014-03-27 10:31:43
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尘埃落定368

铜虫 (小有名气)
请问你找到这个序列的酶切位点了吗/？
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6楼2014-11-20 05:11:02
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zyl623008624

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 尘埃落定368 at 2014-11-20 05:11:02
请问你找到这个序列的酶切位点了吗/？

找到了
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7楼2014-11-24 09:25:17
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裴依小球

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
7楼: Originally posted by zyl623008624 at 2014-11-24 09:25:17
找到了...

求问方法？求mmp-2或者mmp-9酶切位点
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8楼2015-09-14 11:17:49
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裴依小球

新虫 (初入文坛)
顺便请问一下您是否了解，在脑中存在或主要存在而在脑部其他部位没有分布或者分布极少的酶。。。。。。。
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9楼2015-09-14 15:55:03
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Dylan duan

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我是湖南大学的研究生，我也检测这个酶，可以加qq交流一下 532354919
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10楼2018-05-14 21:08:48
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