应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 转录组RNA-seq序列组装
221/1返回列表
查看: 2133  |  回复: 21
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

nonglong1

金虫 (正式写手)

[交流] 转录组RNA-seq序列组装

大家来讨论下:
为什么转录组序列组装会有短的unigene或是不完整的编码区的unigene。
为什么不能组装成一条条完整的转录本？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2014-11-20 16:41:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
转录组测序本来就是把cDNA随机打断之后建库测的，拼不完整很正常。
赞一下 回复此楼
18楼2014-11-22 09:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nonglong1

金虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by growlywolf at 2014-11-22 09:59:05
转录组测序本来就是把cDNA随机打断之后建库测的，拼不完整很正常。

没有拼出来的序列是测序深度不够？所以没有测出来吗？还是已经测序出来了，但是没有拼接起来
赞一下 回复此楼
19楼2014-11-22 22:21:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

growlywolf

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
19楼: Originally posted by nonglong1 at 2014-11-22 22:21:29
没有拼出来的序列是测序深度不够？所以没有测出来吗？还是已经测序出来了，但是没有拼接起来...

建库不完整，测序深度不够，拼接不完全(重复序列)都有可能

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
20楼2014-11-23 10:45:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

an0ta

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
好像外源RNA污染（主要是微生物的）也会造成这种结果
赞一下 回复此楼
22楼2015-01-22 19:42:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
cxjzly20082楼
2014-11-20 16:42   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
天堂方向3楼
2014-11-20 16:46   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
yaoyao1454楼
2014-11-20 16:54   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
chentao5楼
2014-11-20 16:56   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
wang_91126楼
2014-11-20 16:57   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
dmbb7楼
2014-11-20 16:58   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
假大空8楼
2014-11-20 16:58   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
qqaoqq9楼
2014-11-20 17:02   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
专送一血10楼
2014-11-20 17:04   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
time8811楼
2014-11-20 17:05   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
qqllqq12楼
2014-11-20 17:08   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
sz_kebaoyuan13楼
2014-11-20 17:10   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
小虫199214楼
2014-11-20 17:13   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
deweini15楼
2014-11-20 17:14   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
jianing11916楼
2014-11-20 17:15   回复  
nonglong1(金币+2): 谢谢参与
shenrenren17楼
2014-11-20 17:17   回复  
u029902521楼
2015-01-06 01:42   回复  
相关版块跳转 我要订阅楼主 nonglong1 的主题更新
221/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭