应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » Pb2H4优化选择什么基组合适
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
111/2返回列表12下一页
查看: 1629  |  回复: 10
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

茗梵

铁杆木虫 (职业作家)

[求助] Pb2H4优化选择什么基组合适 已有2人参与

优化出pb2h4，并可以用AIM正确分析Pb-Pb键，求大神帮忙
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
加油！
1楼 2014-04-18 16:39:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2014-04-18 18:35:37
茗梵: 金币+5, ★★★很有帮助, 很热心，三克油 2014-04-21 16:04:24
Pb是第六周期元素所以要用赝势基组用的比较多的就是sdd、lanl2dz和def2-TZVPP等等，你可以到EMSL（https://bse.pnl.gov/bse/portal）上选择，而对于氢，则可以用大一点的全电子基组，如果aug-cc-pvtz或者6-311++g（2d，p）等等啦！至于你说要做AIM分析，不建议用高斯去做，一方面用高斯做AIM经常出错，而且对于有赝势的体系处理是个big bug，在保留chk文件之后转换成.fch文件，放到Multiwfn做拓扑分析，http://hi.baidu.com/sobereva/item/896ee3a19f6d7d3c020a4d76。这里面有Sob姐关于Multiwfn的详细教程，很简单的！
赞一下(1人) 回复此楼
平生多磨砺，男儿自横行！
2楼2014-04-18 17:06:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

茗梵

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
2楼: Originally posted by youyno at 2014-04-18 17:06:57
Pb是第六周期元素所以要用赝势基组用的比较多的就是sdd、lanl2dz和def2-TZVPP等等，你可以到EMSL（https://bse.pnl.gov/bse/portal）上选择，而对于氢，则可以用大一点的全电子基组，如果aug-cc-pvtz或者6-311++g（ ...

你好，我用def-tzvpp优化的，H选的aug-cc-pvdz，为什么一直优化都有虚频呢，用的hf方法，虚频在-90多，而且构型也不太正常
赞一下 回复此楼
加油！
3楼2014-04-20 20:03:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)
★ ★
gmy1990: 金币+2 2014-04-20 23:00:53
引用回帖:
3楼: Originally posted by 茗梵 at 2014-04-20 20:03:40
你好，我用def-tzvpp优化的，H选的aug-cc-pvdz，为什么一直优化都有虚频呢，用的hf方法，虚频在-90多，而且构型也不太正常...

虚频的存在可能是采用的方法或者基组不当，如果只有一个虚频而且值不是很大，像你这样-90多，可以参照论坛里一些消虚频的方法，像根据虚频坐标微调构型;另外一种可能就是这种物质是亚稳的，但是相对于过渡态又稳定一点！
赞一下 回复此楼
平生多磨砺，男儿自横行！
4楼2014-04-20 21:54:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

茗梵

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
4楼: Originally posted by youyno at 2014-04-20 21:54:59
虚频的存在可能是采用的方法或者基组不当，如果只有一个虚频而且值不是很大，像你这样-90多，可以参照论坛里一些消虚频的方法，像根据虚频坐标微调构型;另外一种可能就是这种物质是亚稳的，但是相对于过渡态又稳定 ...

最初算出来是-700多的虚频，这是已经调整构型以后的值，已经不是想要的构型了，是物质的问题还是方法问题呢
赞一下 回复此楼
加油！
5楼2014-04-21 14:36:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 茗梵 at 2014-04-21 14:36:06
最初算出来是-700多的虚频，这是已经调整构型以后的值，已经不是想要的构型了，是物质的问题还是方法问题呢...

那开始有-700多虚频的构型是你想要的吗？如果是那就是物质的问题了吧！
赞一下 回复此楼
平生多磨砺，男儿自横行！
6楼2014-04-21 14:47:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永远的跳跳糖

铁虫 (小有名气)
好无奈的说
回复此楼
7楼2014-04-21 15:35:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zhou2009: 金币+5 2014-04-21 18:46:56
茗梵: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 十分感谢 2014-04-22 08:37:53
建议对Pb用cc-pVTZ-PP赝势基组，对H用cc-pVTZ
之所以用cc-pVTZ-PP而不是其它的赝势基组，是因为SDD、lanl2DZ、lanl08之类赝势基组都是大核的，表现不了Pb的亚价层电子，这样会导致AIM分析不准确。详见此文讨论《在赝势下做波函数分析的一些说明》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/ed2f57e743c1be11595dd8c8）

另外，也可以在赝势下优化结构（不限于cc-pVTZ-PP），最后对Pb用SARC-DKH结合int=dkh2来做全电子相对论计算。这样的好处是可以把内核电子表现出来，做AIM分析时会比较方便（优化时就在这个级别也可以，但是注意DKH2没有解析梯度）。

如前面回复所述，做AIM分析用Multiwfn就行了。AIM拓扑分析可参考《使用Multiwfn做拓扑分析以及计算孤对电子角度》（http://hi.baidu.com/sobereva/item/c84fa5089156806dd55a11c3），AIM盆分析可参考手册4.17.1节。
赞一下 回复此楼
8楼2014-04-21 16:16:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zhou2009: 金币+5 2014-04-22 05:50:51
对于虚频问题，在使用上述基组基础上，注意优化时加上opt=tight或verytight关键词，当使用DFT时，结合int=ultrafine。如果虚频还在，在之前优化好的结构基础上加上opt=calcall继续优化，虽然昂贵，但必定能解决虚频问题。

虚频和基组没有必然关系，只要充分优化好，就不会有虚频。
另外，对氢不建议用aug-cc-pVDZ，因为必定结果不如cc-pVTZ，弥散函数对于氢原子几乎起不到任何用处。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

茗梵
9楼2014-04-21 16:20:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youyno

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
zhou2009: 金币+4 2014-04-22 05:48:26
zhou2009: 金币-4, 对不起，错发 2014-04-22 05:50:04
zhou2009: 金币+1 2014-04-22 05:52:25
引用回帖:
9楼: Originally posted by sobereva at 2014-04-21 16:20:08
对于虚频问题，在使用上述基组基础上，注意优化时加上opt=tight或verytight关键词，当使用DFT时，结合int=ultrafine。如果虚频还在，在之前优化好的结构基础上加上opt=calcall继续优化，虽然昂贵，但必定能解决虚频 ...

哈哈！说了是陋见，让Sob姐见笑啦！
赞一下 回复此楼
平生多磨砺，男儿自横行！
10楼2014-04-21 21:17:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 茗梵 的主题更新
111/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 085602调剂 初试总分335 +8 19123253302 2026-04-05 8/400 2026-04-05 20:44 by 南航~万老师
[考研] 数一英一274机械调剂 +5 星陨流霞 2026-04-04 6/300 2026-04-05 11:38 by arrow8852
[考研] 0703化学 +12 妮妮ninicgb 2026-04-04 13/650 2026-04-05 10:46 by 啊俊！
[考研] 一志愿西北农林畜牧专硕336分求调剂 +3 5ourr 2026-04-03 3/150 2026-04-05 10:40 by JOKER0401
[考研] 数一英一 347 人工智能国奖论文都有求调剂 +3 乌拉儿山脉 2026-03-30 7/350 2026-04-05 10:32 by zhq0425
[考研] 085602调剂 初试总分335 +12 19123253302 2026-04-04 12/600 2026-04-05 08:08 by 544594351
[考研] 材料与化工306分找调剂 +12 沧海轻舟e 2026-04-03 13/650 2026-04-04 23:45 by lqwchd
[考研] 考研调剂 +5 四川王涛 2026-04-04 5/250 2026-04-04 22:18 by 啵啵啵0119
[考研] 环境285分，过六级，求调剂 +10 xhr12 2026-04-02 10/500 2026-04-04 21:53 by bn53987
[考研] 298求调剂 +5 zzz，，r 2026-04-02 8/400 2026-04-04 19:55 by 蓝云思雨
[考研] 305求调剂 +3 77Qi 2026-04-03 3/150 2026-04-03 23:01 by qzxyhcsy
[考研] 五邑大学土木工程招调剂生2026 +3 wyutj 2026-03-31 4/200 2026-04-03 18:21 by zengxj_7201
[考研] 319求调剂 +18 太容易1018 2026-04-01 18/900 2026-04-03 11:18 by linyelide
[考研] 324求调剂 +5 想上学求调 2026-04-01 6/300 2026-04-02 10:16 by sanrepian
[考研] 0703一志愿南师大334求调剂 +4 seven7yu 2026-03-30 4/200 2026-04-01 16:10 by oooqiao
[考研] 环境工程调剂 +9 hyzzzzzzz. 2026-04-01 9/450 2026-04-01 14:20 by salamander`
[考研] 材料调剂 +10 Eujd1 2026-03-31 11/550 2026-04-01 11:23 by ivanqyq
[考研] 335求调剂 +3 321* 2026-03-31 4/200 2026-04-01 00:00 by 321*
[考研] 085601 329分调剂 +6 yzsa12 2026-03-31 6/300 2026-03-31 15:23 by yanflower7133
[考研] 英一数一总分334求调剂 +4 陈阳坤 2026-03-31 4/200 2026-03-31 14:22 by 记事本2026
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭