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佳山水成

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于RNA-seq样品处理的问题求助大神们。。。 已有1人参与

我现在要用一个药物修复氧化损伤的模型来评价天然产物的抗氧化作用。想做个RNA-seq大规模筛选一下相关的信号通路。本来是想先加入药物处理,再加入引发剂引起氧化损伤。但是做RNA-seq的老师建议我只用药物处理,不用加引发剂,说加入引发剂相当于第二个处理因子,这样看不出到底是哪一个引起的基因表达。想请教大神们?到底该怎么办?谁有相关的文献什么的发来看看。。。。。。
个人觉得不加引发剂就不算是抗氧化细胞模型了。
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城市稻草人
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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感谢参与,应助指数 +1
不可以药物处理做一个(作为背景),然后加入引发剂以后再做一个?
2楼2014-04-03 00:20:29
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佳山水成

银虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2014-04-03 00:20:29
不可以药物处理做一个(作为背景),然后加入引发剂以后再做一个?

那样就只是纯粹的研究引发剂引起的基因表达差异了,那不是我们的根本目的。我们的最终目的是研究药物在修复氧化损伤中的作用。
城市稻草人
3楼2014-04-06 09:21:53
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
佳山水成: 金币+10, ★★★很有帮助, 多谢 2014-04-09 07:45:12
那肯定要加引发剂,和药物处理一起构成背景
4楼2014-04-07 05:35:54
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