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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 我是做微生物的，老师让我做这种菌的RNA-seq的目的是什么？我该怎么去分析这个结果
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xyoy0629

金虫 (小有名气)

[求助] 我是做微生物的，老师让我做这种菌的RNA-seq的目的是什么？我该怎么去分析这个结果

我是做微生物的，老师让我做这种菌的RNA-seq的目的是什么？我该怎么去分析得到的结果？
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1楼 2013-04-03 14:55:32
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lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
myprayer: 金币+2, 鼓励应助，分子生物版块，期待你的精彩。 2013-04-04 11:11:39
RNA-seq一般用来比较不同条件、不同菌株中的全部基因表达差异。至于做的目的，那要问你老师啊。这个现在都是公司做，数据怎么处理直接跟他们沟通就行了。
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2楼2013-04-03 18:43:57
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xyoy0629

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lcat at 2013-04-03 18:43:57
RNA-seq一般用来比较不同条件、不同菌株中的全部基因表达差异。至于做的目的，那要问你老师啊。这个现在都是公司做，数据怎么处理直接跟他们沟通就行了。

那用什么软件处理之类的，比较不同这些都是和那公司里的人直接沟通，他们就会教吗？你以前做过没有，你做的目的又是什么呢，能不能参考一下？
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3楼2013-04-04 09:19:20
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lcat

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
xyoy0629(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖交流！ 2013-05-31 23:05:20
他们不会教，但是一般数据分析都是已经包含在测序业务里的，你拿到的直接就是做生物学的人可以看懂的数据了。不同的公司可能会开发自己用的分析软件。

我做的是比较不同产量的菌株在不同培养基条件下的全基因组范围基因表达差异。这个目的跟以前用生物芯片做是类似的。一般来说你做RNA-seq需要先有菌株的基因组序列才可以。具体原理、用途等你可以上网搜索，也可以问公司的人，他们肯定给你讲的很细致的。
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4楼2013-04-04 15:57:13
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