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陈浩南-1987

铁虫 (正式写手)

[求助] 细菌RNA的提取

本人想用RT-PCR做细菌的基因表达,请问有没有做过细菌RNA提取的?
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yemuren

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
rainwander(金币+2): 鼓励交流 2011-09-26 17:48:06
首先你要注意要在细菌有转录你的目的基因最高峰的时候收集菌体,迅速冷冻,这样获得的RNA中你目的基因的丰度更高;至于RNA的提取,参照真菌的RNA提取方法就可以了一般用Trizol试剂提取,也有用试剂盒提取的,主要还是要注意所有用具都要去除RNase,使用新的有机溶剂异丙醇氯仿等,提取过程迅速就可以了。
我的专长叫做流浪,所以我就做了流氓~
2楼2011-09-26 16:16:26
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zhymhbu

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yemuren at 2011-09-26 16:16:26:
首先你要注意要在细菌有转录你的目的基因最高峰的时候收集菌体,迅速冷冻,这样获得的RNA中你目的基因的丰度更高;至于RNA的提取,参照真菌的RNA提取方法就可以了一般用Trizol试剂提取,也有用试剂盒提取的,主要 ...

冷冻是指冰箱-20度,还是指液氮冷冻。保存多长时间可以

此外,楼主是做半定量PCR吗
微生物学-发酵工程-生化工程-生化与分子生物学-环境毒理学
3楼2011-09-26 17:07:20
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yemuren

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


rainwander(金币+1): 鼓励交流 2011-09-27 10:38:27
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhymhbu at 2011-09-26 17:07:20:
冷冻是指冰箱-20度,还是指液氮冷冻。保存多长时间可以

此外,楼主是做半定量PCR吗

液氮冷冻,最好是直接液氮研磨,如果没准备好其他的东西的话,先也氮冷冻,然后放到-80冰箱里。保存时间多久没试过,我一般都是直接提,最多的时候放了两天。
我的专长叫做流浪,所以我就做了流氓~
4楼2011-09-26 19:41:01
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陈浩南-1987

铁虫 (正式写手)

大家没有把握住要点,细菌是原核,跟真核的不一样,转录不一样,而且没有polyA尾巴,我就想问问这点如何解决
5楼2011-09-27 21:40:16
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雅yakee

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

怎么知道什么时候是我目的基因最高峰的时候呢?
6楼2012-09-25 15:44:28
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ben1147

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
1929148楼: Originally posted by 陈浩南-1987 at 2011-09-27 21:40:16
大家没有把握住要点,细菌是原核,跟真核的不一样,转录不一样,而且没有polyA尾巴,我就想问问这点如何解决

这点很好解决啊,RT的时候用基因特异引物或者随机引物就行了么。又不是非得用oligo(dT)
7楼2012-09-25 22:27:27
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
1929148楼: Originally posted by 陈浩南-1987 at 2011-09-27 21:40:16
大家没有把握住要点,细菌是原核,跟真核的不一样,转录不一样,而且没有polyA尾巴,我就想问问这点如何解决

先提总RNA,反转录时不用oligo dT引物,可以用随机引物或者基因特异引物。如果你的目的基因的丰度不是很低的话,用随机引物比较好,这样合成的cDNA可以想做什么基因就做,方便比较。
8楼2012-09-26 10:16:47
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