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xwnail2003

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pymol

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感谢参与,应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-20 14:08:43
xwnail2003: 金币+5, 有帮助 2014-11-24 16:16:36
xwnail2003: 金币+5 2014-11-25 11:18:32
1:活性为点选择可以参考其中的几个氨基酸,然后gridbox 设置包裹住这些残基,当然需要对活性中心应当非常了解:
2:analyz分析dlg文件的时候,可以按照构象或者能量排序
7楼2014-11-20 11:22:04
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

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xwnail2003: 金币+5, 有帮助 2014-11-20 10:50:12
1.通过center,offset,可以调整位置,结合机理将grid 调整到活性位置,实在不知道活性位置,把它最大化,整个分子包在grid 里。

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-11-20 06:42:19
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
xwnail2003: 金币+5, 有帮助 2014-11-20 10:50:55
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-20 14:08:30
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2014-11-20 06:42:19
1.通过center,offset,可以调整位置,结合机理将grid 调整到活性位置,实在不知道活性位置,把它最大化,整个分子包在grid 里。

2.num_mod一般给出9个bindind affinity,第一个能量最低

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-11-20 06:58:29
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)

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4楼2014-11-20 10:50:40
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