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xwnail2003

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1楼 2014-11-19 19:54:54
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xwnail2003: 金币+5, ★有帮助 2014-11-20 10:50:12
1.通过center,offset,可以调整位置，结合机理将grid 调整到活性位置，实在不知道活性位置，把它最大化，整个分子包在grid 里。

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2楼2014-11-20 06:42:19
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
xwnail2003: 金币+5, ★有帮助 2014-11-20 10:50:55
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-20 14:08:30
引用回帖:
2楼: Originally posted by wbf3ng at 2014-11-20 06:42:19
1.通过center,offset,可以调整位置，结合机理将grid 调整到活性位置，实在不知道活性位置，把它最大化，整个分子包在grid 里。

2.num_mod一般给出9个bindind affinity，第一个能量最低

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3楼2014-11-20 06:58:29
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
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4楼2014-11-20 10:50:40
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
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5楼2014-11-20 10:51:46
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
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6楼2014-11-20 10:58:24
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
abinitio: 金币+1, 鼓励交流 2014-11-20 14:08:43
xwnail2003: 金币+5, ★有帮助 2014-11-24 16:16:36
xwnail2003: 金币+5 2014-11-25 11:18:32
1：活性为点选择可以参考其中的几个氨基酸，然后gridbox 设置包裹住这些残基，当然需要对活性中心应当非常了解:
2：analyz分析dlg文件的时候，可以按照构象或者能量排序
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7楼2014-11-20 11:22:04
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xwnail2003

禁虫 (著名写手)
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8楼2014-11-24 16:17:55
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pymol

捐助贵宾 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xwnail2003 at 2014-11-24 16:17:55
我用的是vina,没有dlg文件，是否就按照构象排序？...

可以选取其中的构象分析
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9楼2014-11-25 14:45:02
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