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seallinsky

木虫 (正式写手)

小木虫总版主

[求助] 牛IgG蛋白序列 已有3人参与

uniprot上实在找不到牛的IgG序列。。。求助各位虫友，最好能提供uniprot号，谢谢！
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小木虫总版主
1楼 2014-11-13 10:24:19
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seallinsky

木虫 (正式写手)

小木虫总版主
引用回帖:
6楼: Originally posted by louis_cheung at 2014-11-14 01:40:41
脊椎动物的IgG是一类蛋白，不是一个蛋白，即使是同一物种的IgG,根据重链或轻链，通常又可分为好几个亚类，即使是同一亚类，其germline 序列也有很多条，重排后突变的就数不胜数了~不知亲要哪一条?
...

IgG保守序列，最好是通过基因编码过来的序列
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小木虫总版主
7楼2014-11-23 10:44:11
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-11-14 09:15:00
抗体的特点就是每一个序列都不相同，重链和轻链的可变区序列都是随机的，数据库一般都不收录的。如果你要找一些序列来参考，建议你到NCBI上搜索一些结晶结构，有结晶的IgG都会给出序列。给你一个例子http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?uid=111112
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2楼2014-11-13 11:34:19
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seallinsky

木虫 (正式写手)

小木虫总版主
引用回帖:
2楼: Originally posted by liuderong at 2014-11-13 11:34:19
抗体的特点就是每一个序列都不相同，重链和轻链的可变区序列都是随机的，数据库一般都不收录的。如果你要找一些序列来参考，建议你到NCBI上搜索一些结晶结构，有结晶的IgG都会给出序列。给你一个例子http://www.ncb ...

我是做蛋白组学的，SwissProt的review的蛋白里居然没有收录牛的IgG蛋白（我也不敢相信），需要基因编码的精确的蛋白一级结构，比如人的Ig gamma-1 chain C region（P01857）序列这种
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小木虫总版主
3楼2014-11-13 13:23:31
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liuderong

铁杆木虫 (正式写手)
★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-11-14 09:15:05
引用回帖:
3楼: Originally posted by seallinsky at 2014-11-13 13:23:31
我是做蛋白组学的，SwissProt的review的蛋白里居然没有收录牛的IgG蛋白（我也不敢相信），需要基因编码的精确的蛋白一级结构，比如人的Ig gamma-1 chain C region（P01857）序列这种...

感觉你不了解抗体产生的机理，有空找一本免疫学方面的书看一下吧。一头牛如果有100万个成熟的B细胞，那它就有可能有100万个IgG，并且每一个都是不同的。单就同一个B细胞而言，它在发育的不同阶段产生的IgG也是不同的！
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4楼2014-11-13 19:15:15
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