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丫头爱泡泡

新虫 (初入文坛)

[求助] 已知基因序列,在NCBI上计算蛋白大小

已知基因序列,怎样在NCBI上计算蛋白大小?
知道了蛋白序列,怎么查它的活性中心在哪个位点?

跪求各位大神学霸!!
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
给个具体的基因吧,可以拿这个基因作为例子帮你分析!
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-11-22 10:16:10
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Davidzjy

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-11-22 16:48:07
丫头爱泡泡: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-11 12:16:45
基因序列不等于蛋白序列
因此你所知道的基因序列只能用来在genbank等数据库中寻找对应的基因名
再通过其基因名找到对应的蛋白质名和它的序列 序列有了 分子量也就有了

关于蛋白的各种结构域 一般两种方法
1 研究较多的蛋白可以直接在PDB里找到 或者找到其同源蛋白 不仅各种结合位点 调控位点都有标记 连3D结构都能看到
2 用蛋白质预测软件 工具非常多 各种方面的都有 小木虫上面各种资源帖 教学帖都很多
特殊结构或结构预测的个人喜欢使用COILS
MacStripe也是不错的工具
3楼2013-11-22 11:11:10
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丫头爱泡泡

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-11-22 10:16:10
给个具体的基因吧,可以拿这个基因作为例子帮你分析!

GTGAGAAACAGTGAGCGAGTGCAGTGCGTGATCTCCGGTATCTGCTGCTGCGTGTGCGCCTACATCGCTCTCACCATCGCCGGCAGCTACAGTAACTGGTTCTGGTACTACTGGGTGCCCCTGAGCTTCTTTGGTCTGATGCTCGTGATCGTGACCTACCTCCAGCATGTGGACGACGTGGCCGAGGTGTACGAAGCTGACGAGTGGAGTTTTGTGAGGGGACAGACCCAGACCATCGACCGCTACTACGGTCTGGGCCTCGACACCACCATGCATCACATCACCGACGGTCACGTGGCCCATCACTTCTTTAACAAGATCCCACATTACCACCTGATCGAAGCTACCGAGGGCGTGAAGAAGGTGCTGGAGCCCCTCAGCGACAC
辛苦啦~
4楼2013-12-11 12:15:19
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丫头爱泡泡

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Davidzjy at 2013-11-22 11:11:10
基因序列不等于蛋白序列
因此你所知道的基因序列只能用来在genbank等数据库中寻找对应的基因名
再通过其基因名找到对应的蛋白质名和它的序列 序列有了 分子量也就有了

关于蛋白的各种结构域 一般两种方法
1  ...

恩呢,我也去学一下~
5楼2013-12-11 12:16:02
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