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weido

新虫 (正式写手)

[求助] NCBI上酶蛋白序列含有信号肽吗（原核）

高手指点：本人想克隆一个酶（原核）的基因，原核表达，不知道NCBI上酶蛋白序列含有信号肽吗，以及对表达和酶活性有什么影响，另外对于酶的基因序列是不是要进行改造表达出来才有活性。谢谢！
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1楼 2013-03-07 11:11:31
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gaojuan1985

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
weido: 金币+2 2013-03-08 09:21:45
weido: 金币+2 2013-03-15 19:27:15
自己点上去看，如果有信号肽的话，会显示sig peptide。没有这一栏的，几乎就是没有。你也可以把氨基酸序列输到SignalP这个软件里面去检测一下。
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2楼2013-03-07 11:20:44
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qqxs

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
weido: 金币+2 2013-03-08 09:21:49
weido: 金币+2 2013-03-15 19:27:19
有的有，有的没有，有的会在cds里显示说明
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3楼2013-03-07 11:59:56
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小丹木木: 金币+2, 鼓励应助 2013-03-07 16:59:19
weido: 金币+2 2013-03-08 09:21:52
你查的该蛋白序列要看当时这个上传的人是否将信号肽含在其中，所以有的有有的没有，你可以将氨基酸序列输入到预测软件里一看便知。
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生物化学与分子生物学
4楼2013-03-07 14:27:04
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weido

新虫 (正式写手)
Name=Sequence        SP='YES' Cleavage site between pos. 25 and 26: AHA-KD D=0.794 D-cutoff=0.570 Networks=SignalP-noTM
非常感谢各位，我在网上预测了一下，这句话是不是表明有信号肽了？
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5楼2013-03-07 16:30:13
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lidonghong

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by weido at 2013-03-07 16:30:13
Name=Sequence        SP='YES' Cleavage site between pos. 25 and 26: AHA-KD D=0.794 D-cutoff=0.570 Networks=SignalP-noTM
非常感谢各位，我在网上预测了一下，这句话是不是表明有信号肽了？

是的，位点就在25和26号氨基酸之间，意思就是1-25是信号肽区域
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生物化学与分子生物学
6楼2013-03-08 11:12:53
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