应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 转录组拿到数据后，要着么用呀
41/1返回列表
查看: 2235  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

qaz139687

新虫 (小有名气)

[求助] 转录组拿到数据后，要着么用呀 已有1人参与

我要做的基因是octopamine，已经找到我要的基因片段了，下面不知道该着么做，求大神指点  下面附上我的片段

>comp280062_c0;orf1 len=912  frame:2  start:2  end:913  Octopamine receptor 2 [Crassostrea gigas]
CGCCATAAAAAGAAACATTGTAACATTGATAATGACAATGAAACAAGTTGTATTAATCCG
CATCCAGCTACAACATGCACAACTCAAATAGACTTACAACCTCCTATTGTCATGAAAGAC
AAATCCACACAAATTAGTCCGCTTCCTAAAAGACCTTTACGGAAATCTACAGAAGACCCC
AAGTTAAAAGGAAATAATCTTAATAACGAAAAAGATCTTAAAACTAACAGTTCGACAATG
TTGCTTACAGTAAGCAACGATGTGAAAGGATCAGCTGAACAGCAAACACAAGCTGGTCCT
AAAACAAAACAACCCGTGTCTGCAATGAACGGGAAGAAAAAGCACATTGAACCTAGTCGT
TCAACTGACGATAACGATGAGAACGGGATAGTAATGGACGACAGCTCCGGTGACACTGTC
AGTTATAAGGAAGAAAATATATGCTGCAGTGGATGTGCATGCAAGTCGTGTTCTCCTATG
TTCAATTGTTTGATTATAAAACGTTCTAATAAAAACAACAATAATCAGAGACGTGACAGC
GAAGGTCATAAATCTTTAAAAATTAAAAAAGGCAGTTCCTTGAAGAAACGTGCAATACAA
CTACGGAATAAAAGTATGACTGGTATAAAGAGTAAATATGAACTAAGAGAACAGAGAGCA
ACTAAAAGAATGGCAATAGTAATGGCATGTTTCTGTTTTTGTTGGATCCCTTTCCTATTT
ATGTATTTAATTCGAAGCTTCTGTGATAATTGTGAACTTGACATTCATATACAGGCTGCC
ATTATCTGGCTAGGATATGCCAACTCCGGTATAAATCCTATTTTATATACTCTATTCAAT
GATGACTTCCGCAGAGCCTTTGAGATAATTCTTGGAATTAGACGATCAAAACATAAGAAA
CGGAGACATTAG
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-10-17 14:51:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
qaz139687(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-10-17 15:46:41
qaz139687: 金币+1 2014-10-19 14:38:55
接下来要做基因注释，计算每个基因的表达水平啥的。如果你做的是RNA-Seq，可以用Galaxy在线分析pipeline做，或者下载CLC Genomics Workbench软件做（商业版的，操作简单，可以试用若干天）
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-10-17 15:34:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qaz139687

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-17 15:34:10
接下来要做基因注释，计算每个基因的表达水平啥的。如果你做的是RNA-Seq，可以用Galaxy在线分析pipeline做，或者下载CLC Genomics Workbench软件做（商业版的，操作简单，可以试用若干天）

不懂，不是说什么要先去NCBI上面比对吗
赞一下 回复此楼
3楼2014-10-19 14:38:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

peterrjp

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by qaz139687 at 2014-10-19 14:38:57
不懂，不是说什么要先去NCBI上面比对吗...

基因组比较适合在NCBI上做比对，转录组的数据一般比较大，直接在NCBI上做可能比较麻烦。CLC Genomics Workbench软件处理速度很快，新版本能连到NCBI上做基因注释。
赞一下 回复此楼
4楼2014-10-19 18:26:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 qaz139687 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 求b区院校调剂 +3 周56 2026-03-24 4/200 2026-03-25 13:17 by 周56
[考研] 284求调剂 +15 Zhao anqi 2026-03-22 15/750 2026-03-25 12:51 by wht0531
[考研] 085602 289分求调剂 +6 WWW西西弗斯 2026-03-24 6/300 2026-03-25 11:52 by userper
[考研] 材料调剂 +3 iwinso 2026-03-23 3/150 2026-03-25 11:29 by greychen00
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +3 袁奂奂 2026-03-25 6/300 2026-03-25 11:08 by 袁奂奂
[考研] 286求调剂 +11 Faune 2026-03-21 11/550 2026-03-25 10:11 by 雾散后相遇lc
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考博] 申博26年 +4 八6八68 2026-03-19 4/200 2026-03-24 15:49 by 小Ben呵呵
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 327求调剂 +5 prayer13 2026-03-23 5/250 2026-03-23 22:11 by 星空星月
[考研] 361求调剂 +3 Glack 2026-03-22 3/150 2026-03-23 22:03 by fuyu_
[考研] 350求调剂 +6 weudhdk 2026-03-19 6/300 2026-03-23 15:47 by tangyuan0840221
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 311求调剂 +3 勇敢的小吴 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:40 by ColorlessPI
[考研] 22408 344分 求调剂 一志愿 华电计算机技术 +4 solanXXX 2026-03-20 4/200 2026-03-20 23:49 by alg094825
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 一志愿西南交通 专硕 材料355 本科双非 求调剂 +5 西南交通专材355 2026-03-19 5/250 2026-03-20 21:10 by JourneyLucky
[考研] 求调剂 +3 eation27 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:32 by JourneyLucky
[考研] 本科郑州大学物理学院，一志愿华科070200学硕，346求调剂 +4 我不是一根葱 2026-03-18 4/200 2026-03-19 09:11 by 浮云166
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭