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qaz139687

新虫 (小有名气)

[求助] 转录组拿到数据后,要着么用呀已有1人参与

我要做的基因是octopamine,已经找到我要的基因片段了,下面不知道该着么做,求大神指点  下面附上我的片段

>comp280062_c0;orf1 len=912  frame:2  start:2  end:913  Octopamine receptor 2 [Crassostrea gigas]
CGCCATAAAAAGAAACATTGTAACATTGATAATGACAATGAAACAAGTTGTATTAATCCG
CATCCAGCTACAACATGCACAACTCAAATAGACTTACAACCTCCTATTGTCATGAAAGAC
AAATCCACACAAATTAGTCCGCTTCCTAAAAGACCTTTACGGAAATCTACAGAAGACCCC
AAGTTAAAAGGAAATAATCTTAATAACGAAAAAGATCTTAAAACTAACAGTTCGACAATG
TTGCTTACAGTAAGCAACGATGTGAAAGGATCAGCTGAACAGCAAACACAAGCTGGTCCT
AAAACAAAACAACCCGTGTCTGCAATGAACGGGAAGAAAAAGCACATTGAACCTAGTCGT
TCAACTGACGATAACGATGAGAACGGGATAGTAATGGACGACAGCTCCGGTGACACTGTC
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GAAGGTCATAAATCTTTAAAAATTAAAAAAGGCAGTTCCTTGAAGAAACGTGCAATACAA
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ATTATCTGGCTAGGATATGCCAACTCCGGTATAAATCCTATTTTATATACTCTATTCAAT
GATGACTTCCGCAGAGCCTTTGAGATAATTCTTGGAATTAGACGATCAAAACATAAGAAA
CGGAGACATTAG
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qaz139687

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by peterrjp at 2014-10-17 15:34:10
接下来要做基因注释,计算每个基因的表达水平啥的。如果你做的是RNA-Seq,可以用Galaxy在线分析pipeline做,或者下载CLC Genomics Workbench软件做(商业版的,操作简单,可以试用若干天)

不懂,不是说什么要先去NCBI上面比对吗
3楼2014-10-19 14:38:57
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