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静谧limi

铜虫 (小有名气)

[交流] 有对基因组分析了解的吗?当你测序出两个相似的基因,怎么进行分析? 已有3人参与

如题

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cuihao102

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主研究的化合物应该有已经报道的同种家族化合物的基因簇,找到这一家族的基因簇,然后和你基因在一起对比,应该就会找到保守区域,这样就有可能发现你要的差异。
6楼2014-09-30 11:41:26
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静谧limi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by fanlet at 2014-09-27 15:28:52
列一下差异

如果知道两种亲缘关系比较近的菌株,由于其中一个产某种化合物,而另一个不产,想通过分析基因来找到决定产的基因簇

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2014-09-27 15:52:08
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cuihao102

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
只通过两个基因组的对比可能比较费劲!应该找一下同类或者同一家族化合物的生物合成基因簇,对比一下来获得,一般基因组测序或者基因组扫描的结果都应该给个大概的基因功能推测!
4楼2014-09-27 18:42:24
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静谧limi

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cuihao102 at 2014-09-27 18:42:24
只通过两个基因组的对比可能比较费劲!应该找一下同类或者同一家族化合物的生物合成基因簇,对比一下来获得,一般基因组测序或者基因组扫描的结果都应该给个大概的基因功能推测!

对比后怎么分析结果呢?新手求教,谢了

[ 发自小木虫客户端 ]
5楼2014-09-29 22:50:37
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