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dxia85

新虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
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红花: 2
帖子: 213
在线: 126.5小时
虫号: 1571400
注册: 2012-01-10
性别: MM
专业: 理论和计算化学

[求助] 请教AMBER做膜蛋白动力学模拟的过程

利用CHARMM-GUI构建了一个膜蛋白体系，体系包含蛋白+配体+膜+水+抗衡离子，请问跑动力学模拟的时候的过程是怎么设置呢？麻烦知道的给我个详细过程吧，比如优化的时候先固定哪个后固定哪个等等？跑平衡的时候是不是也需要先固定膜和蛋白，然后放开膜，然后对于蛋白，也是不同的限制力进行平衡呢？谢谢！

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1楼 2014-08-25 14:43:45

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虫虫妃9527

本帖内容被屏蔽

3楼2021-08-07 19:59:54

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 3 个回答

君不知msc

新虫 (初入文坛)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 16
帖子: 10
在线: 8.4小时
虫号: 7070790
注册: 2017-08-16
专业: 理论和计算化学

楼主还在不？？能不能有个联系方式啊导师刚给安排的让用charmm gui 构建膜蛋白想请教一下咋么做的

2楼2017-09-14 17:22:41

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