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dxia85

新虫 (小有名气)

[求助] 请教AMBER做膜蛋白动力学模拟的过程

利用CHARMM-GUI构建了一个膜蛋白体系,体系包含蛋白+配体+膜+水+抗衡离子,请问跑动力学模拟的时候的过程是怎么设置呢?麻烦知道的给我个详细过程吧,比如优化的时候先固定哪个后固定哪个等等?跑平衡的时候是不是也需要先固定膜和蛋白,然后放开膜,然后对于蛋白,也是不同的限制力进行平衡呢?谢谢!
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君不知msc

新虫 (初入文坛)

楼主还在不??  能不能有个联系方式啊    导师刚给安排的让用charmm gui 构建膜蛋白   想请教一下咋么做的
2楼2017-09-14 17:22:41
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3楼2021-08-07 19:59:54
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