应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 真菌多样性研究中引物选择问题~~~
151/2返回列表12下一页
查看: 2654  |  回复: 14
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

琢研

铜虫 (小有名气)

[求助] 真菌多样性研究中引物选择问题~~~ 已有3人参与

小妹初涉分子，将做真菌多样性研究，采用高通量方法，有如下疑问向各位大虾请教：1、这个方法选用18S还是ITS作为引物的结果更准确啊？2、因为我们实验室之前未涉及分子方面的研究，土壤样品采回后一部分用于分析理化，另一部分则储存于-80摄氏度冰箱，最早期的样品接近两年时间，所以想问下--这种低温长时间储存会对结果造成什么样的影响呢？
        谢谢大家~不胜感激~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-08-14 17:23:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逍潇

铁杆木虫 (著名写手)
同问，帮顶。不过你的样品-80度放两年，这个时间也太长了吧，对做分子方面的实验多少不利。
赞一下 回复此楼
2楼2014-08-14 18:08:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

琢研

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 逍潇 at 2014-08-14 18:08:36
同问，帮顶。不过你的样品-80度放两年，这个时间也太长了吧，对做分子方面的实验多少不利。

对啊！其实主要想知道影响有多大？得到的结果是否还有用?不然花了大量人力财力物力，结果不能用，那就糟糕了啊？？？    ps:你也是做相关研究的么？？
赞一下 回复此楼
3楼2014-08-15 10:26:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逍潇

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 琢研 at 2014-08-15 10:26:21
对啊！其实主要想知道影响有多大？得到的结果是否还有用?不然花了大量人力财力物力，结果不能用，那就糟糕了啊？？？    ps:你也是做相关研究的么？？...

是的，不过还没开始，准备要做的。感觉做真菌多样性研究的文章选ITS的似乎多一点。你想知道影响有多大，取个样出来提DNA，看看提的质量如何。
赞一下 回复此楼
4楼2014-08-15 12:01:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

539595873

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
呃，2年。。。。。。估计做不出来什么东西了。。。
如果是做多样性，可以用DGGE，我做海洋底泥细菌多样性就用的这个。18S是测序用的，需要纯品。ITS是什么东西，没用过。。。
赞一下 回复此楼
考博的苦逼孩子
5楼2014-08-15 14:17:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逍潇

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 539595873 at 2014-08-15 14:17:56
呃，2年。。。。。。估计做不出来什么东西了。。。
如果是做多样性，可以用DGGE，我做海洋底泥细菌多样性就用的这个。18S是测序用的，需要纯品。ITS是什么东西，没用过。。。

http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=1935213
赞一下 回复此楼
6楼2014-08-15 14:44:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

天52琳

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
多样性的话 可以采用Est SSR RAPD等这些分子标记比较好，ITS是真菌里面最常用的DNA条形码序列，有非常高的赞誉，建议用ITS 18S 用于属以上的系统分析 但目前在真菌里面，利用18S 28S EF1-a RPB1 RPB2 beta-tublin等多基因序列进行分析的比较多
赞一下 回复此楼
7楼2014-08-15 20:38:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

琢研

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 逍潇 at 2014-08-15 12:01:20
是的，不过还没开始，准备要做的。感觉做真菌多样性研究的文章选ITS的似乎多一点。你想知道影响有多大，取个样出来提DNA，看看提的质量如何。...

嗯~~~这个可以有！！！我也还没开始做呢！现在还处于看文献找方法阶段。好捉急的~~
    你课题组有师兄师姐做过相关的么？
    ITS可以做原核生物多样性么？？
赞一下 回复此楼
8楼2014-08-16 16:58:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

琢研

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 天52琳 at 2014-08-15 20:38:16
多样性的话 可以采用Est SSR RAPD等这些分子标记比较好，ITS是真菌里面最常用的DNA条形码序列，有非常高的赞誉，建议用ITS 18S 用于属以上的系统分析 但目前在真菌里面，利用18S 28S EF1-a RPB1 RPB2 beta-tublin等 ...

O(∩_∩)O谢谢~初入分子~脑补中！！！受教啦~~~
赞一下 回复此楼
9楼2014-08-16 17:07:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

逍潇

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 琢研 at 2014-08-16 16:58:02
嗯~~~这个可以有！！！我也还没开始做呢！现在还处于看文献找方法阶段。好捉急的~~
    你课题组有师兄师姐做过相关的么？
    ITS可以做原核生物多样性么？？...

实验室以前没人做啊，老板突然想做这一块。做原核生物比如细菌一般就用16s rDNA了。你做高通量打算用什么测序平台？
赞一下 回复此楼
10楼2014-08-16 17:27:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 琢研 的主题更新
151/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 07:32 by winsaint
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 4/200 2026-08-29 05:45 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 国自然评审意见 +11 wangmingqi 2026-08-28 15/750 2026-08-29 00:17 by fangyl2005
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 基金不中，共勉 +11 eulota 2026-08-26 11/550 2026-08-28 14:22 by 火星超人xi
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 面上合作单位盖章 +5 ssyjh 2026-08-27 5/250 2026-08-27 20:50 by gdfollow
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了！？ +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 某些机构，以效率低为荣，以效率低作为存在感 +9 yuleib84 2026-08-25 10/500 2026-08-25 17:14 by alexon
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭