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研究肉中微生物多样性,肉DNA对后面高通量测序(细菌16S、真菌ITS1)有什么影响? 已有1人参与
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并没有对肉中微生物进行分离培养,是直接提取肉中微生物的DNA,所提取的DNA一定含有肉的DNA。 测序公司说,这会使测序时很浪费,尽可能不要把肉的DNA提取出来。 难道就没有真菌特异性引物吗? 初学者,而且还是非分子生物学专业的,勿拍。 求指导。 |
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3楼2014-08-05 14:44:39
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我最近看到一篇文献,挺好的,PCR-SSCP-based reconstruction of the original fungal flora of heat-processed meat products ————Samart Dorn-In a,⁎, Christina S. Hölzel a, Tobias Janke a, Karin Schwaiger,2013 International Journal of Food Microbiology 附件上传不了 共勉 之前我一直问测序公司有没有只扩增真菌ITS1的特异性引物,她一直说没有,她说尽可能不要把肉的DNA提取出来,尽可能去除。思维就定在了怎么尽可能不把肉DNA提取出来,就没有想到换个思维,为什么就没有特异性引物呢? |
4楼2014-08-09 15:51:24












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