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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 真菌多样性研究中引物选择问题~~~
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琢研

铜虫 (小有名气)

[求助] 真菌多样性研究中引物选择问题~~~ 已有3人参与

小妹初涉分子，将做真菌多样性研究，采用高通量方法，有如下疑问向各位大虾请教：1、这个方法选用18S还是ITS作为引物的结果更准确啊？2、因为我们实验室之前未涉及分子方面的研究，土壤样品采回后一部分用于分析理化，另一部分则储存于-80摄氏度冰箱，最早期的样品接近两年时间，所以想问下--这种低温长时间储存会对结果造成什么样的影响呢？
        谢谢大家~不胜感激~
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1楼 2014-08-14 17:23:04
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琢研

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 天52琳 at 2014-08-15 20:38:16
多样性的话 可以采用Est SSR RAPD等这些分子标记比较好，ITS是真菌里面最常用的DNA条形码序列，有非常高的赞誉，建议用ITS 18S 用于属以上的系统分析 但目前在真菌里面，利用18S 28S EF1-a RPB1 RPB2 beta-tublin等 ...

O(∩_∩)O谢谢~初入分子~脑补中！！！受教啦~~~
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9楼2014-08-16 17:07:06
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逍潇

铁杆木虫 (著名写手)
同问，帮顶。不过你的样品-80度放两年，这个时间也太长了吧，对做分子方面的实验多少不利。
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2楼2014-08-14 18:08:36
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琢研

铜虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 逍潇 at 2014-08-14 18:08:36
同问，帮顶。不过你的样品-80度放两年，这个时间也太长了吧，对做分子方面的实验多少不利。

对啊！其实主要想知道影响有多大？得到的结果是否还有用?不然花了大量人力财力物力，结果不能用，那就糟糕了啊？？？    ps:你也是做相关研究的么？？
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3楼2014-08-15 10:26:21
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逍潇

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 琢研 at 2014-08-15 10:26:21
对啊！其实主要想知道影响有多大？得到的结果是否还有用?不然花了大量人力财力物力，结果不能用，那就糟糕了啊？？？    ps:你也是做相关研究的么？？...

是的，不过还没开始，准备要做的。感觉做真菌多样性研究的文章选ITS的似乎多一点。你想知道影响有多大，取个样出来提DNA，看看提的质量如何。
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4楼2014-08-15 12:01:20
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