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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 水体中微生物群落多样性分析
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nier6566

新虫 (初入文坛)

[求助] 水体中微生物群落多样性分析

我是环科专业的小硕，最近需要研究“水体中微生物群落多样性分析 ”，打算用PCR-DGGE做，请高人指点：
1、在做水体中总DNA提取时，一般用什么提取方法？
2、PCR引物扩增，一般选取哪些通用引物？需要区分细菌、真菌、放线菌吗 引物吗？
麻烦各位 不吝赐教
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nier6566 nier6566 zoujyjs

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1楼 2012-05-15 20:06:45
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nier6566

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
怎么没有人理我
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2楼2012-05-16 13:50:36
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nier6566

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
3楼2012-05-16 13:52:39
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north_coco887

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nier6566: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-05-16 21:54:08
1.做DNA提取的时候，有比较成熟的试剂盒，MO BIO和MP的都不错，可以查一下相关的文献。
2.DGGE做多样性分析，不能跨界，细菌是细菌，真菌是真菌，通用引物也比较多，V3-V5区的比较常见，也是要根据自己需要来选择。
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4楼2012-05-16 15:34:04
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swaucq

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
nier6566: 金币+2, ★有帮助 2012-05-17 14:08:47
用试剂盒提取，进口的比好些，国内的百泰克也凑合，便宜一些。细菌，包括放线菌一般用的是提取16SDNA的引物，真菌用ITS的引物较多。
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不卑不亢
5楼2012-05-17 10:22:59
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zoujyjs

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
顶起！希望知道的可以指导一下！
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6楼2012-05-17 20:11:25
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zhcxiamen

新虫 (初入文坛)
★
rainwander: 金币+1, 鼓励交流 2012-05-18 13:40:47
水体中微生物群落，首先要用抽滤装置对水中微生物进行抽提过滤，菌体留在滤纸上，滤纸剪碎进行细菌DNA的提取，有专门提取水中细菌DNA的试剂盒，保证了提取的水体菌群DNA的质量后才能进行后续的DGGE电泳等
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7楼2012-05-18 11:22:31
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panmeiycgxy

铁虫 (小有名气)
我也要用DGGE，请知道的多指导下，谢谢！
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8楼2012-05-18 14:24:46
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qinxuan

铜虫 (初入文坛)
环境微生物多样性454高通量分析就可以啦，有意向的话可以联系啊
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9楼2012-12-04 09:27:19
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