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Insecta_A

铜虫 (小有名气)

[求助] 请教DNA电泳的浓度及电压时间设置 已有5人参与

大家好,我PCR产物预计大小在90—200左右,请问我用琼脂糖电泳时胶的浓度选择多少?同时电泳时的电压以及时间?谢谢!
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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【答案】应助回帖

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Insecta_A: 金币+2, 有帮助 2014-08-13 10:42:01
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-13 12:29:26
用2%~2.5%便可。
电压90V就可以了,不要太高。
时间半小时内(20~30min应该就可以了,可以经常看看)
2楼2014-08-13 09:14:59
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盛夏海棠

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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Insecta_A: 金币+1, 有帮助 2014-08-13 10:42:09
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-13 12:29:33
PCR产物片段越小跑的越快,需要用浓度高些的胶,2%就可以,电压高的话跑的也快,一般loading buffer会有指示作用,一般跑到胶的一半时就可以看结果了
天道酬勤
3楼2014-08-13 09:18:01
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hbsdz

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by Insecta_A at 2014-08-22 10:30:01
请问,我一般用微波炉中火打2分钟左右,我感觉微波炉在加热的时候会蒸发,如果做2%的胶(0.7g+35ml 1X TAE)是不是真实的胶浓度就会高一些,所以我想请问你平时在做的时候,大概会多加多少ml的缓冲液来弥补蒸发的损 ...

我也是用的2分钟微波炉加热,我一般多加2-4mL的1X TAE溶液。110V  20----25分钟左右。希望可以帮到你。
我的邮箱:hbsdzml@163.com
11楼2014-09-10 11:10:02
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普通回帖

ncuduhan

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-08-13 12:29:48
Insecta_A: 金币+1, 有帮助 2014-08-13 20:45:35
琼脂糖浓度/%         0.3         0.6         0.7         0.9         1.2         1.5         2.0
线状DNA大小/kb         60-5         20-1         10-0.8         7-0.5         6-0.4         4-0.2         3-0.1
4楼2014-08-13 12:13:45
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Insecta_A

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-13 09:14:59
用2%~2.5%便可。
电压90V就可以了,不要太高。
时间半小时内(20~30min应该就可以了,可以经常看看)

请问,我一般用微波炉中火打2分钟左右,我感觉微波炉在加热的时候会蒸发,如果做2%的胶(0.7g+35ml 1X TAE)是不是真实的胶浓度就会高一些,所以我想请问你平时在做的时候,大概会多加多少ml的缓冲液来弥补蒸发的损失?
5楼2014-08-22 10:30:01
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

Translator and Proofreader


引用回帖:
5楼: Originally posted by Insecta_A at 2014-08-21 14:30:01
请问,我一般用微波炉中火打2分钟左右,我感觉微波炉在加热的时候会蒸发,如果做2%的胶(0.7g+35ml 1X TAE)是不是真实的胶浓度就会高一些,所以我想请问你平时在做的时候,大概会多加多少ml的缓冲液来弥补蒸发的损 ...

两分钟是不是太长了?微波炉的功率多大?
一般不需要这么长时间。只要看到开了就停下来,摇动一会。过几分钟基本就可以了。如果仍然没有完全溶解,则可以继续加热一会,仍然不需要长时间处于沸腾状态。
6楼2014-08-22 10:36:05
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Hliotrope

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


Insecta_A: 金币+1, 有帮助 2014-08-22 15:53:48
2%胶,140V以内就行,电压高跑的快一些,Loading Buffer电泳速度与300bp大小DNA速度一样,所以别让loading buffer跑太前,跑到胶一半处就差不多了。。。
Someone
7楼2014-08-22 11:05:31
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Insecta_A

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-22 10:36:05
两分钟是不是太长了?微波炉的功率多大?
一般不需要这么长时间。只要看到开了就停下来,摇动一会。过几分钟基本就可以了。如果仍然没有完全溶解,则可以继续加热一会,仍然不需要长时间处于沸腾状态。...

用的中火,你们一般是怎样做的呢
8楼2014-08-22 15:53:20
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清晨甲壳虫

铜虫 (初入文坛)

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Insecta_A(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-10 18:14:18
我们常用 1%琼脂糖凝胶,电压130∨电压。具体取决于核酸片段大小,浮动应该不大~

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2014-08-22 16:15:15
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清晨甲壳虫

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


Insecta_A(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-09-10 18:14:30
超纯水加入琼脂糖之后,微波炉中高火五分钟左右,看到底部沸腾气泡即可~

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2014-08-22 16:17:05
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