应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps的minimize会丢失原子
31/1返回列表
查看: 2483  |  回复: 6
查看全部回帖 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

digghost

木虫 (著名写手)

[交流] lammps的minimize会丢失原子 已有3人参与

今天使用了8月8日的版本运行下面的脚本，出现lost atom 错误。但使用以前 2013 12月的版本却可以运算。然后用count（all，whole）数了一下box中的原子数，发现以前的版本中的原子确实丢了，只是由于没检查，所以可以运行。最新版的要10个步长检查一次守恒条件，所以出错。希望大家在计算的时候注意一下。另外有谁知道lost atoms的原因么？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
呵呵了
1楼 2014-08-11 12:26:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gulubaozi

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
附上相关命令看看
赞一下 回复此楼
4楼2014-08-12 11:52:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gulubaozi

银虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by digghost at 2014-08-12 13:27:12
# Input file for bi-layered crystal, Nickle and Aluminum, relaxed
# Tikelia Wright, July 2012

# ------------------------ INITIALIZATION ----------------------
clear
units                 metal
dimension        3
...

可能是minimize 1e-15 1e-15 5000 5000里边的min极限太小所致
赞一下 回复此楼
6楼2014-08-13 08:51:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 digghost 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭