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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS计算无反应，nan
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WJ-MS

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS计算无反应，nan

自己改写了一段小的程序，运行之后没有反应，一直停留在如下的状态：

Setting up minimization ...
Memory usage per processor = 9.03804 Mbytes
Step Temp E_pair E_mol TotEng Press
       0            0          nan            0          nan          nan

之前在小木虫上求助过，有高手回复说，他那边是可以计算的，有结果出来，可是我试过两台电脑都没有反应，是计算容量不足还是其他什么问题阿？

望各位相助！！！
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  • 附件 1 : in.NaCl
    • 2012-12-17 09:31:53, 1.34 K

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加油！
1楼 2012-12-17 09:32:28
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-12-18 08:38:03
很明显，你的原子位置太过靠近，导致势能无限大，连minimize也无法运行。 因为你产生随机原子。 你需要检查原子坐标进行修正。
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

WJ-MS
2楼2012-12-17 11:00:58
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WJ-MS

新虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ddll_slsl at 2012-12-17 11:00:58
很明显，你的原子位置太过靠近，导致势能无限大，连minimize也无法运行。 因为你产生随机原子。 你需要检查原子坐标进行修正。

之前我在小木虫上提问过，有一个人回复说他那边是可以计算的，所以也不知道是机器的问题还是体系的问题……想要模拟计算熔盐的结构，应该怎么构建模型啊
赞一下 回复此楼
加油！
3楼2012-12-17 22:03:31
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ddll_slsl

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by WJ-MS at 2012-12-17 22:03:31
之前我在小木虫上提问过，有一个人回复说他那边是可以计算的，所以也不知道是机器的问题还是体系的问题……想要模拟计算熔盐的结构，应该怎么构建模型啊...

你的原子是随机产生的，情况各不相同。。有的运气好些， 没有产生太大重叠而已。。。
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4楼2012-12-18 08:51:19
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大懒猫王浩

金虫 (著名写手)

学渣
挖一下坑，昨天也遇到了NAN的问题，主要是Pt-Graphene体系，有时候能完成运行，有时候就会突然体系完全消失。。。尝试了很多方法，最后换了新版本，一点问题的没有，应该是2018版本USER-MEAMC有bug，2021版本修复了。。。所以可以尝试更改版本。。试试。
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一步一步往上走，，，，
5楼2021-01-28 10:41:38
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