| 查看: 3724 | 回复: 7 | ||
zhang_jaj木虫 (正式写手)
|
[求助]
lammps文件原子属性显示问题-atomeye, OVITO, Pymol 已有1人参与
|
|
因为计算完后获取了atom几种不同的属性值，比如CNA，现在想按照这几种值来显示颜色。有几个问题： 1. 用atomeye显示这种属性颜色是最方便的，但是问题是颜色方案不太好，总是调不到区分度较大的颜色。有个比较好的显示rainbow方案，不过在一些期刊上又嫌这个颜色online版和print版的灰度值一样（蓝和红）没法区分。 2. 用OVITO显示的颜色相对来说很好看，不过颜色方案貌似更少。只有jet，hot， grayscale和rainbow。而且我找了好久没法调整颜色，不知道谁有比较好的方法吗？并且这个软件没法让atom周期平移来显示想要的某个面的图像吗？只能通过切面吗？还有这里能隐藏某些没选择了atom吗，没有找到。 3. 对于Pymol（颜色也很漂亮），如果想显示不同的颜色，是只能按照之前的属性编程把atom变成不同的元素名字并转为pdb文件吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
071000生物学调剂
已经有3人回复
-
085600材料与化工301分求调剂院校
已经有5人回复
-
081700，311，求调剂
已经有15人回复
-
一志愿北京化工085600 310分求调剂
已经有18人回复
-
材料与化工371求调剂
已经有14人回复
-
336材料与化工085600求调剂
已经有7人回复
-
材料334求调剂
已经有18人回复
-
331求调剂
已经有8人回复
-
332求调剂
已经有17人回复
-
一志愿南京航空航天大学 材料与化工329分求调剂
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- LAMMPS跟踪原子
已经有10人回复
- lammps的minimize会丢失原子
已经有6人回复
- 【500金币本版活动】“经验力场分子模拟+第一性原理计算问题讨论互助及资源共享”
已经有82人回复
2楼2014-07-23 07:59:29
zhang_jaj
木虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 2135.7
- 散金: 693
- 红花: 8
- 帖子: 447
- 在线: 448小时
- 虫号: 1015849
- 注册: 2010-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2014-07-23 20:50:36
4楼2014-07-24 09:00:30
zhang_jaj
木虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 2135.7
- 散金: 693
- 红花: 8
- 帖子: 447
- 在线: 448小时
- 虫号: 1015849
- 注册: 2010-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
5楼2014-07-24 19:59:36
daicong
木虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 2886.8
- 散金: 74
- 帖子: 160
- 在线: 79.1小时
- 虫号: 1397910
- 注册: 2011-09-11
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及
6楼2014-12-05 04:35:44
zhang_jaj
木虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 2135.7
- 散金: 693
- 红花: 8
- 帖子: 447
- 在线: 448小时
- 虫号: 1015849
- 注册: 2010-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
7楼2014-12-05 08:08:49
Momosilence
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 108.4
- 帖子: 37
- 在线: 18小时
- 虫号: 10949624
- 注册: 2018-10-20
- 性别: GG
- 专业: 微/纳机械系统
8楼2020-11-20 22:43:10
