| 查看: 3673 | 回复: 7 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
zhang_jaj木虫 (正式写手)
|
[求助]
lammps文件原子属性显示问题-atomeye, OVITO, Pymol 已有1人参与
|
|
|
因为计算完后获取了atom几种不同的属性值，比如CNA，现在想按照这几种值来显示颜色。有几个问题： 1. 用atomeye显示这种属性颜色是最方便的，但是问题是颜色方案不太好，总是调不到区分度较大的颜色。有个比较好的显示rainbow方案，不过在一些期刊上又嫌这个颜色online版和print版的灰度值一样（蓝和红）没法区分。 2. 用OVITO显示的颜色相对来说很好看，不过颜色方案貌似更少。只有jet，hot， grayscale和rainbow。而且我找了好久没法调整颜色，不知道谁有比较好的方法吗？并且这个软件没法让atom周期平移来显示想要的某个面的图像吗？只能通过切面吗？还有这里能隐藏某些没选择了atom吗，没有找到。 3. 对于Pymol（颜色也很漂亮），如果想显示不同的颜色，是只能按照之前的属性编程把atom变成不同的元素名字并转为pdb文件吗？ |
回复此楼» 猜你喜欢
268求调剂
已经有7人回复
-
一志愿重庆大学085700资源与环境总分308求调剂
已经有4人回复
-
302求调剂
已经有11人回复
-
306求调剂
已经有4人回复
-
材料学学硕080502 337求调剂-一志愿华中科技大学
已经有4人回复
-
求调剂
已经有6人回复
-
313求调剂
已经有3人回复
-
南昌大学材料专硕311分求调剂
已经有6人回复
-
316求调剂
已经有6人回复
-
346求调剂[0856]
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- LAMMPS跟踪原子
已经有10人回复
- lammps的minimize会丢失原子
已经有6人回复
- 【500金币本版活动】“经验力场分子模拟+第一性原理计算问题讨论互助及资源共享”
已经有82人回复
Momosilence
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 108.4
- 帖子: 37
- 在线: 18小时
- 虫号: 10949624
- 注册: 2018-10-20
- 性别: GG
- 专业: 微/纳机械系统
8楼2020-11-20 22:43:10
2楼2014-07-23 07:59:29
zhang_jaj
木虫 (正式写手)
- 应助: 14 (小学生)
- 金币: 2135.7
- 散金: 693
- 红花: 8
- 帖子: 447
- 在线: 448小时
- 虫号: 1015849
- 注册: 2010-05-11
- 性别: GG
- 专业: 凝聚态物性I:结构、力学和
3楼2014-07-23 20:50:36
4楼2014-07-24 09:00:30
