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zhang_jaj木虫 (正式写手)
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lammps文件原子属性显示问题-atomeye, OVITO, Pymol 已有1人参与
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因为计算完后获取了atom几种不同的属性值,比如CNA,现在想按照这几种值来显示颜色。有几个问题: 1. 用atomeye显示这种属性颜色是最方便的,但是问题是颜色方案不太好,总是调不到区分度较大的颜色。有个比较好的显示rainbow方案,不过在一些期刊上又嫌这个颜色online版和print版的灰度值一样(蓝和红)没法区分。 2. 用OVITO显示的颜色相对来说很好看,不过颜色方案貌似更少。只有jet,hot, grayscale和rainbow。而且我找了好久没法调整颜色,不知道谁有比较好的方法吗?并且这个软件没法让atom周期平移来显示想要的某个面的图像吗?只能通过切面吗?还有这里能隐藏某些没选择了atom吗,没有找到。 3. 对于Pymol(颜色也很漂亮),如果想显示不同的颜色,是只能按照之前的属性编程把atom变成不同的元素名字并转为pdb文件吗? |
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zhang_jaj
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