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仲尼

新虫 (小有名气)

[求助] 动物组织研磨和裂解问题 已有3人参与

本人近期欲做western blot,样品是动物胃肠道(四个胃和大小肠)、肾脏、肮脏,研究对象是细胞膜上的一种通道蛋白。由于是第一次做western,有如下问题,希望热心的虫友帮忙,
①我的方法是:先将组织剪碎,并加入适量RIPA裂解液,然后用手持式组织研磨器研磨(实验室没有玻璃匀浆器)。在组织研磨过程中发现,大、小肠黏膜很容易研磨;但是,瘤胃壁、肾脏和肝脏等,用上面方法的就不容易研磨,总是剩余一些组织块,不知道还有没有其他好的方法
②做过类似的试验的小伙伴们,想问下哪个公司的RIPA裂解液(裂解膜上的蛋白)好些;还有就是用不用加入蛋白酶抑制剂,如PMSF
谢谢各位了
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
仲尼(西门吹雪170代发): 金币+3, 鼓励回帖交流 2014-08-10 10:26:40
仲尼: 金币+1, ★★★很有帮助 2014-08-15 11:38:23
1、要达到好的匀浆效果,只有用电动式匀浆器。其实肝脏、肾脏应该更容易匀浆,这些组织比较“脆”,而胃肠道则含有大量平滑肌,相对较难些。如果你的蛋白只在胃肠粘膜上皮表达,则可以考虑将胃肠粘膜刮下来。
2、RIPA buffer不需要买,自己配置就可以了,成分简单(网上随便一搜就可以找到配方)。另外尽可能加入蛋白酶抑制剂, 最方便的是Roche公司的cOmplete Protease Inhibitor Cocktail Tablets (http://labs.mmg.pitt.edu/gjoerup/protease%20inhibitor.pdf)。如果你的目标蛋白是一种磷酸化蛋白,而且与你的研究相关联,则尚需加入磷酸酶抑制剂。
3楼2014-08-10 09:40:31
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普通回帖

for5

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
仲尼(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-08-10 10:26:26
1.液氮研磨
2.要加,如果是磷酸化还要加磷酸化抑制剂,一般有cocktail
操蛋的XX
2楼2014-08-10 09:30:51
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仲尼

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by for5 at 2014-08-10 09:30:51
1.液氮研磨
2.要加,如果是磷酸化还要加磷酸化抑制剂,一般有cocktail

十分感谢!另外,我要检测的是目的蛋白的总量(可能包括磷酸化的和未磷酸化的),这样的话是不是可以不加磷酸化酶抑制剂呢?
4楼2014-08-10 10:02:57
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仲尼

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-10 09:40:31
1、要达到好的匀浆效果,只有用电动式匀浆器。其实肝脏、肾脏应该更容易匀浆,这些组织比较“脆”,而胃肠道则含有大量平滑肌,相对较难些。如果你的蛋白只在胃肠粘膜上皮表达,则可以考虑将胃肠粘膜刮下来。
2、R ...

好的,十分感谢!
那个蛋白酶抑制剂还是挺贵的,如果没有条件可以只加PMSF吗?
我要检测的是目标蛋白的总量(可能有磷酸化的),这样的话是不是可以不加磷酸酶抑制剂呢
5楼2014-08-10 10:18:14
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ssssllllnnnn

至尊木虫 (知名作家)

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引用回帖:
5楼: Originally posted by 仲尼 at 2014-08-09 21:18:14
好的,十分感谢!
那个蛋白酶抑制剂还是挺贵的,如果没有条件可以只加PMSF吗?
我要检测的是目标蛋白的总量(可能有磷酸化的),这样的话是不是可以不加磷酸酶抑制剂呢...

可以呀。如果你不太关心磷酸化的问题可以不加。
对了,做蛋白的时候,只要有可能尽量在冰上做,否则降解是个问题。
6楼2014-08-10 10:20:11
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仲尼

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by ssssllllnnnn at 2014-08-10 10:20:11
可以呀。如果你不太关心磷酸化的问题可以不加。
对了,做蛋白的时候,只要有可能尽量在冰上做,否则降解是个问题。...

好的,谢谢
7楼2014-08-10 10:38:08
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hululu0725

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2014-10-04 22:19:05
我们用筛网研磨,效果还不错,另外RIPA,碧云天公司的还不错,裂解强度有强中弱,适合磷酸化还是非磷酸化的WB,说明书上都有,很便宜,小几百,还有PMSF最好加的
8楼2014-08-12 15:18:26
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仲尼

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by hululu0725 at 2014-08-12 15:18:26
我们用筛网研磨,效果还不错,另外RIPA,碧云天公司的还不错,裂解强度有强中弱,适合磷酸化还是非磷酸化的WB,说明书上都有,很便宜,小几百,还有PMSF最好加的

筛网如何研磨呢?把组织放在筛子上,然后加液氮研磨吗?
9楼2014-08-13 08:44:34
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hululu0725

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
9楼: Originally posted by 仲尼 at 2014-08-13 08:44:34
筛网如何研磨呢?把组织放在筛子上,然后加液氮研磨吗?...

可以加液氮也可以不用,我们用注射器柄研磨,筛网漏下的就是细胞悬液,比较好裂解

[ 发自小木虫客户端 ]
10楼2014-08-13 09:41:32
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