24小时热门版块排行榜    

查看: 1020  |  回复: 4

千年夏日

新虫 (初入文坛)

[求助] 【求助】关于干标本提取基因组的问题

我要从一些鳞翅目的干标本中提取基因组。标本主要是11年和12年夏天采集的。虫体是用乙酸乙酯毒死后做成标本。
摸索了两个多月,仍然没能成功提取出基因组。一直用的是SDS裂解法、酚氯仿提取。
很多情况下都是在100bp以下有一个大的亮带(如下图),基因组应该是mark旁那个胶空的亮带。
现在不明白的是,那些下面的亮带是基因组都降解成了小片段吗?
从干标本里提基因组有什么技巧吗?求各位同学老师解答!谢谢!!

未命名.jpg
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
降解的比较厉害。提基因组应该尽量用新鲜的组织。如果要保存上比较长时间,可以泡在乙醇里,这样比干标本好很多
2楼2012-12-17 15:33:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

千年夏日

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gaoyang636 at 2012-12-17 15:33:16
降解的比较厉害。提基因组应该尽量用新鲜的组织。如果要保存上比较长时间,可以泡在乙醇里,这样比干标本好很多

那请问 降解的原因是保存过程中引起的吗?
研磨样品有可能会使样品降解到这个程度吗?
3楼2012-12-17 17:07:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 千年夏日 at 2012-12-17 17:07:31
那请问 降解的原因是保存过程中引起的吗?
研磨样品有可能会使样品降解到这个程度吗?...

不是研磨的问题,是DNase降解,细胞凋亡/死亡,dna断裂,酶解了。
4楼2012-12-18 08:59:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

vamyluo

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
首先,针对这样的样本,建议你尽量使用效率较高的试剂盒;
其次,如果实在不想用试剂盒的话,建议你在提取过程中加入适量的DNA祝沉缓冲剂,如乙酸钠等,具体原理和参数请自己查阅下相关文献。
5楼2012-12-20 02:22:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 千年夏日 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 v7Aev8ORQjin 2026-08-22 3/150 2026-08-23 20:58 by 0p9y1isJp2jM
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 19:55 by lXgU0RvNTDC9
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 19:43 by lXgU0RvNTDC9
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 19:31 by lXgU0RvNTDC9
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 19:22 by lXgU0RvNTDC9
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 4/200 2026-08-23 19:22 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 8/400 2026-08-23 18:58 by lXgU0RvNTDC9
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 18:55 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 15:30 by KM5EcsNQRBPn
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 10:44 by IXZuIJ2Q7OVy
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 03:52 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3 炎黄贵胄 2026-08-22 4/200 2026-08-22 20:02 by mycsru
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
信息提示
请填处理意见