版块导航
正在加载中...
客户端APP下载
论文辅导
申博辅导
登录
注册
帖子
帖子
用户
本版
应《网络安全法》要求,自2017年10月1日起,未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用,请尽快对帐号进行手机号验证,感谢您的理解与支持!
24小时热门版块排行榜
>
论坛更新日志
(2956)
>
虫友互识
(296)
>
导师招生
(203)
>
文献求助
(176)
>
论文投稿
(59)
>
休闲灌水
(59)
>
博后之家
(52)
>
招聘信息布告栏
(46)
>
考研
(38)
>
硕博家园
(37)
>
考博
(34)
>
基金申请
(23)
>
SciFinder/Reaxys
(22)
>
教师之家
(17)
>
留学DIY
(16)
>
绿色求助(高悬赏)
(16)
小木虫论坛-学术科研互动平台
»
计算模拟区
»
分子模拟
»
Gromacs/Amber/NAMD
»
大家交流一下水盒子大小
2
1/1
返回列表
查看: 2790 | 回复: 1
只看楼主
@他人
存档
新回复提醒
(忽略)
收藏
在APP中查看
yulilan
金虫
(初入文坛)
应助: 2
(幼儿园)
金币: 1507.6
帖子: 37
在线: 91.9小时
虫号: 2070131
注册: 2012-10-18
性别:
MM
专业: 合成药物化学
[
求助
]
大家交流一下水盒子大小
已有1人参与
大家在amber中做动力学模拟用多大水盒子?盒子大小有什么限制。
回复此楼
» 猜你喜欢
存款400万可以在学校里躺平吗
已经有18人回复
国自然申请面上模板最新2026版出了吗?
已经有19人回复
拟解决的关键科学问题还要不要写
已经有7人回复
请教限项目规定
已经有3人回复
基金委咋了?2026年的指南还没有出来?
已经有10人回复
基金申报
已经有6人回复
推荐一本书
已经有13人回复
纳米粒子粒径的测量
已经有8人回复
疑惑?
已经有5人回复
计算机、0854电子信息(085401-058412)调剂
已经有5人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
Gromacs里关于设定水盒子形状的问题??
已经有7人回复
求助,关于Gromacs生成的水盒子中加小分子。
已经有7人回复
怎样用能量和温度判断体系达到收敛了?(600ps水盒子温度波动还很大)
已经有31人回复
gromacs蛋白计算结束后老是跑出盒子
已经有19人回复
vmd显示模拟盒子边界是不是每一步都得在命令界面上手动设置
已经有7人回复
lammps中change_box命令的使用,无法将模拟体系放在模拟盒子中间位置 急求~!
已经有10人回复
动力学模拟水分子跑散了怎么办?水盒子严重变形,出现空洞。
已经有8人回复
如何计算溶剂盒子密度
已经有15人回复
水分子的分子动力学模拟中水分子跑出盒子
已经有10人回复
MS中如何设置将分子放在模拟盒子的中心处
已经有15人回复
在MS中建造石墨烯的周期性结构,如何得到立方形的盒子
已经有12人回复
夹透射试样的镊子和装TEM试样的盒子
已经有9人回复
MS建盒子,放入溶质,如何再空隙处添加水分子?
已经有9人回复
discover模拟,分子跑到盒子外面怎么办
已经有5人回复
有没有那种可以充氮气的密封盒子?
已经有20人回复
求问关于真空盒子的作用。
已经有12人回复
请教做MD计算时,蛋白质分子有一部分跑出水盒子
已经有9人回复
【求助】怎样才能使整个盒子充满水,用gromacs
已经有6人回复
【讨论】大家讨论下水相合成和有机相合成得到的各种纳米粒子的优缺点
已经有5人回复
【交流】将8个完全相同的球放到3个不同的盒子中
已经有20人回复
【求助】水盒子问题
已经有17人回复
我所需要的是科研精神。。。
1楼
2014-07-21 11:04:34
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
explorer2250
新虫
(初入文坛)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 54.4
帖子: 11
在线: 64小时
虫号: 712321
注册: 2009-03-02
【答案】应助回帖
★
感谢参与,应助指数 +1
yulilan(月只蓝代发): 金币+1, 感谢指导!
2014-07-22 18:57:07
盒子的大小和你的截断半径有关;当然体系大的话,你要保证盒子里的蛋白在两个周期内不会相互影响。
赞
一下
回复此楼
高级回复
2楼
2014-07-22 11:25:15
已阅
回复此楼
关注TA
给TA发消息
送TA红花
TA的回帖
相关版块跳转
第一性原理
量子化学
计算模拟
分子模拟
仿真模拟
程序语言
我要订阅楼主
yulilan
的主题更新
2
1/1
返回列表
如果回帖内容含有宣传信息,请如实选中。否则帐号将被全论坛禁言
普通表情
龙
兔
虎
猫
百度网盘
|
360云盘
|
千易网盘
|
华为网盘
在新窗口页面中打开自己喜欢的网盘网站,将文件上传后,然后将下载链接复制到帖子内容中就可以了。
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭
确定