应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 菌种资源 » 不知道选怎样的序列进行系统发育树的构建，选多少？
51/1返回列表
查看: 3729  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

会飞的青菜妹

木虫 (小有名气)

[求助] 不知道选怎样的序列进行系统发育树的构建，选多少？ 已有4人参与

已经16S rDNA 测序，然后在NCBI进行比对，但是不知道选怎样的序列进行系统发育树的构建，选多少？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-05-25 21:49:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

20093651

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
dllchina: 金币+2, 鼓励应助 2014-05-27 18:41:44
在NCBI上的序列质量不高哈，建议去http://www.ezbiocloud.net/ 比对，这上面都是有效序列，会对你选择序列有很大帮助，祝好
赞一下 回复此楼
但行好事，莫问前程
6楼2014-05-27 16:18:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
看NCBI比对结果，如果绝大多数，比如，前一二十个都是一个属的，相似度也很高，原则上，调取本属全部序列画树即可，为了树形稳定，可以加上邻近属的典型种作为外群（outgroup）。
如果是属，就比较麻烦了，建议你先看看推荐的帖子
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2014-05-26 10:21:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

会飞的青菜妹

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by dllchina at 2014-05-26 10:21:14
看NCBI比对结果，如果绝大多数，比如，前一二十个都是一个属的，相似度也很高，原则上，调取本属全部序列画树即可，为了树形稳定，可以加上邻近属的典型种作为外群（outgroup）。
如果是属，就比较麻烦了，建议你先 ...

如果是属，就比较麻烦,这什么意思，鉴定出来比对，都查的是属啊
赞一下 回复此楼
3楼2014-05-26 17:18:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dllchina

木虫 (著名写手)

有机的微生物大神

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 会飞的青菜妹 at 2014-05-26 17:18:31
如果是属，就比较麻烦,这什么意思，鉴定出来比对，都查的是属啊...

意思是离得最近的是不同属的，考虑是新属，画树就稍微麻烦点，不过嘛是相对新种说的

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2014-05-26 18:31:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭