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ruchang2013

铁虫 (初入文坛)

[求助] 这是重组后的验证 已有1人参与

这是pTKIP-cat与一段2.3kb的核酸片段做的重组工作,图为PCR验证及酶切验证。
IP1/glk2、galP1/IP2这2对引物,若重组成功,应该有1.5kb左右的条带,显然这样大小的条带不存在,说明重组失败,那为什么会存在大条带?
“对”为pTKIP-cat,若重组成功,重组质粒是7kb

这是重组后的验证
2014.0427 17菌PCR酶切.png
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
ruchang2013(西门吹雪170代发): 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-05-12 17:58:15
ruchang2013: 金币+3, 谢谢,是不是酶切时间也过短啊!我这次将质粒重新酶切观察到2条带,一条在3kb~5kb,另一条带在2kb~3kb,质粒本身是4kb。我一般酶切3~4h。或者体系不对?我是20μL加0.5μL的酶。 2014-05-13 16:48:57
引物与重组质粒其他位置发生的非特异结合,有大条带很正常~
你的marker最大量程是5K而你的重组质粒是7K?marker不太合适,换一个更大一些的吧。不过从图上看连的不是你的基因,酶切偏小,PCR也没有,重组失败。~
大家相互帮助哈
2楼2014-05-12 15:13:20
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luwei13566

木虫 (正式写手)

你是双酶切还是单酶切验证的?BglII和ApaI??pTKIP载体上好像没有BglII切割位点把。。
大家相互帮助哈
3楼2014-05-13 17:43:45
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906394648

新虫 (初入文坛)

★ ★ ★
gyesang: 金币+3, 鼓励回帖交流! 2014-06-01 16:58:21
用质粒跑胶理论上会出现三条带,一条是你说的7k的,还有一条是超螺旋结构的,应该是乘以0.6后的4.2k,还有一条是间于这两条带之间的,有可能是双链有可能是半螺旋。
4楼2014-05-13 19:52:51
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luwei13566

木虫 (正式写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流经验! 2014-06-01 16:58:29
我一般都是20ul加1ul酶 37度4个小时。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

大家相互帮助哈
5楼2014-05-13 20:52:37
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ruchang2013

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-13 17:43:45
你是双酶切还是单酶切验证的?BglII和ApaI??pTKIP载体上好像没有BglII切割位点把。。

核算片段上有BglII位点,用BglII,那就是单酶切验证了。ApaI是双酶切验证,因为在pTKIP上ApaI酶切后,插入核算片段,那么酶切验证用此酶时就是双酶切验证啦
6楼2014-05-14 14:34:26
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ruchang2013

铁虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
5楼: Originally posted by luwei13566 at 2014-05-13 20:52:37
我一般都是20ul加1ul酶 37度4个小时。

谢谢,那么过夜酶切没影响吧,酶切不能超过多长时间啊
7楼2014-05-14 14:35:27
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luwei13566

木虫 (正式写手)

★ ★
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖交流! 2014-06-01 16:58:57
引用回帖:
6楼: Originally posted by ruchang2013 at 2014-05-14 14:34:26
核算片段上有BglII位点,用BglII,那就是单酶切验证了。ApaI是双酶切验证,因为在pTKIP上ApaI酶切后,插入核算片段,那么酶切验证用此酶时就是双酶切验证啦...

双酶切验证只需要看看你的两条带的大小是否一致即可。至于酶切时间不同公司的效果不一样,而且你用的buffer一致的话还好,如果本身就不太兼容的话还是不要过夜切了。Takara的内切酶我最高试过37度6个小时,如果过夜的话不要有37度了,容易切碎,16度或者25度过夜比较合适
大家相互帮助哈
8楼2014-05-14 15:27:23
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