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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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seamas_gao1

银虫 (小有名气)

[求助] 转录组测序中如何利用paired-end reads进行补洞?

我最近在学习转录组拼接的过程,有以下几个问题希望解答:
1. 获得Contig后,如何通过paired-end reads来确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离?从而得到scaffold。
2. 如何利用paired-end reads对Scaffold做补洞处理,从而最后得到含N最少,两端不能再延长的序列,即Unigene

在PE100中paired-end reads不就是100bp的序列吗,为什么都补这么多的洞呢,如何实现的呢?谢谢!
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seamas_gao1

银虫 (小有名气)

自己顶一下
2楼2014-04-03 10:05:57
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seamas_gao1

银虫 (小有名气)

没有人知道吗?
3楼2014-04-14 08:41:32
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