| 查看: 445 | 回复: 2 | |||
seamas_gao1银虫 (小有名气)
|
[求助]
转录组测序中如何利用paired-end reads进行补洞？
|
|
我最近在学习转录组拼接的过程，有以下几个问题希望解答： 1. 获得Contig后，如何通过paired-end reads来确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离？从而得到scaffold。 2. 如何利用paired-end reads对Scaffold做补洞处理，从而最后得到含N最少，两端不能再延长的序列，即Unigene 在PE100中paired-end reads不就是100bp的序列吗，为什么都补这么多的洞呢，如何实现的呢？谢谢！ |
回复此楼» 猜你喜欢
留学--博士招生
已经有16人回复
-
化学工程，本211，求调剂，ab区不限
已经有4人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有209人回复
-
湖北师范大学招调剂啦
已经有7人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
317分 一志愿江南大学 化学工程学硕 求调剂
已经有6人回复
-
化工申博
已经有1人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 请教，有转录组高通量测序的得到的差异表达基因，筛选几个基因出来进行功能鉴定
已经有9人回复
- 求助转录组测序完成后，后续荧光定量、基因克隆引物设计问题
已经有8人回复
- 有没有人做过植物方面的转录组测序？
已经有5人回复
- 求转录组测序相关文章
已经有14人回复
- 有关转录组测序的两个问题，谢谢！
已经有3人回复
- 做转录组测序,只做了对照组和处理组两个样本,每个样本都没有做生物学重复,好发文章吗
已经有12人回复
- 转录组测序后的序列在NCBI上BLAST后遇到的一些问题，求解答
已经有5人回复
- 转录组测序投稿
已经有5人回复
- 急！急！急！对转录组测序结果进行验证，如何选定基因
已经有9人回复
- 转录组测序还是基因组测序？
已经有6人回复
- 转录组测序所需RNA提取
已经有14人回复
- 请教转录组测序公司哪家好？
已经有5人回复
- 《求助》 转录组样品，混合与分开测序的区别？！！！
已经有13人回复
- 转录组和蛋白质组测序分析接种后感病和抗病植物能分析到什么水平
已经有5人回复
- Illumina solexa转录组测序
已经有8人回复
- 植物转录组测序
已经有19人回复
- 2011NSFC申请时写的用基因芯片，现在准备改成转录组测序，不知这样调整行不行？
已经有6人回复
- 转录组测序 可行性
已经有12人回复
- 求高人翻译关于水稻转录组测序的一段摘要
已经有1人回复
- 用Trinity进行de novo拼装
已经有16人回复
- 转录组数据分析免费软件
已经有11人回复
seamas_gao1
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1617.5
- 散金: 15
- 帖子: 192
- 在线: 29.9小时
- 虫号: 1879385
- 注册: 2012-07-05
- 专业: 水产养殖学
2楼2014-04-03 10:05:57
seamas_gao1
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1617.5
- 散金: 15
- 帖子: 192
- 在线: 29.9小时
- 虫号: 1879385
- 注册: 2012-07-05
- 专业: 水产养殖学
3楼2014-04-14 08:41:32
