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seamas_gao1银虫 (小有名气)
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转录组测序中如何利用paired-end reads进行补洞？
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我最近在学习转录组拼接的过程，有以下几个问题希望解答： 1. 获得Contig后，如何通过paired-end reads来确定来自同一转录本的不同Contig以及这些Contig之间的距离？从而得到scaffold。 2. 如何利用paired-end reads对Scaffold做补洞处理，从而最后得到含N最少，两端不能再延长的序列，即Unigene 在PE100中paired-end reads不就是100bp的序列吗，为什么都补这么多的洞呢，如何实现的呢？谢谢！ |
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