| 查看: 1872 | 回复: 5 | |||
wungung金虫 (初入文坛)
|
[求助]
gromacs安装后无法使用 已有5人参与
|
|
我已经安装好gromacs了，但是安装后按照教程实例跑项目，不能用。我输入命令pdb2gmx，界面显示：bash:pdb2gmx:command not found... 是不是我的软件没有安装好呀？还是路径的问题呀？哪位可以帮个忙呢？ PS：我的安装过程： root账户下tar xfz gromacs-4.6.3.tar.gz cd gromacs-4.6.3 mkdir build cd build cmake .. -DGMX_BUILD_OWN_FFTW=ON make sudo make install 安装应该是没有问题吧…… 如果是路径问题的话应该怎么解决呢？ 谢谢了！ |
回复此楼» 猜你喜欢
0857调剂
已经有3人回复
-
材料学调剂
已经有11人回复
-
材料类求调剂
已经有11人回复
-
高分子化学与物理调剂
已经有11人回复
-
26申博
已经有6人回复
-
328求调剂
已经有5人回复
-
化工专硕348，一志愿985求调剂
已经有8人回复
-
0856求调剂285
已经有8人回复
-
290求调剂
已经有11人回复
-
281求调剂
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- autodock与gromacs在Windows下的安装
已经有10人回复
- 求助！查看gromacs的拉伸过程VMD崩溃！
已经有6人回复
- GROMACS运行完后的结果分析
已经有4人回复
- 求助！SW6-----1998怎么安装呢 老师给了我们 我们装不起呢
已经有5人回复
- gromacs 模拟出现周期性问题
已经有6人回复
- EXCEED安装问题(高版本覆盖不了低版本)
已经有8人回复
- 跑完Gromacs的动力学模拟之后的轨迹文件.trr里面没有内容，为什么？
已经有4人回复
- gromacs编译安装
已经有11人回复
- 离子液体模拟：如何从别的软件移植力场到Gromacs（itp文件的含义以及如何写itp文件）
已经有4人回复
- gromacs无法生成gro文件
已经有5人回复
- 求用到AMBER force field的开源软件
已经有10人回复
- ssh端gromacs无法运行
已经有5人回复
- 如何使用gromacs进行多分子模拟？
已经有7人回复
- gromacs oplsaa 力场中的原子类型
已经有6人回复
- 如何用MS的纳米管坐标转到gromacs可识别的文件
已经有7人回复
- grompp无法识别原子类型
已经有7人回复
- 请教GROMACS安装
已经有8人回复
- Gromacs是如何算溶液的介电常数的啊
已经有4人回复
- 用AutoDock作分子对接前的小分子能量最小化问题
已经有6人回复
- 【求助】如何使用gromacs中的constraint
已经有8人回复
- 【求助】这是我安装gromacs过程，但是出错阿，这个怎么办呢？谢谢
已经有11人回复
- 【求助】安装问题，安装后程序无法执行
已经有12人回复
- 【求助】demo运行不了？
已经有12人回复
- Sigmaplot安装后无法使用
已经有5人回复
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+20, 感谢！ 2014-03-21 11:12:55
月只蓝: 金币+2, 专家考核, 感谢指导！ 2014-03-21 16:28:12
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+20, 感谢！ 2014-03-21 11:12:55
月只蓝: 金币+2, 专家考核, 感谢指导！ 2014-03-21 16:28:12
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2014-03-20 16:59:47
zhenwuhuang
至尊木虫 (文学泰斗)
- 应助: 4351 (副教授)
- 金币: 10236.3
- 散金: 1
- 红花: 137
- 帖子: 65921
- 在线: 2433.7小时
- 虫号: 2227382
- 注册: 2013-01-07
- 性别: GG
- 专业: 人类营养
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+1 2014-03-21 11:14:22
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-21 16:28:17
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+1 2014-03-21 11:14:22
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-21 16:28:17
3楼2014-03-20 17:04:10
4楼2014-03-20 17:18:21
lisuperyao
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 22641.7
- 散金: 2500
- 红花: 4
- 帖子: 3048
- 在线: 273.5小时
- 虫号: 1210362
- 注册: 2011-02-23
- 专业: 化学反应工程
5楼2014-03-20 17:35:23
旺仔小馒头01
木虫 (正式写手)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 4917.2
- 红花: 13
- 帖子: 520
- 在线: 111.5小时
- 虫号: 1310118
- 注册: 2011-05-30
- 性别: GG
- 专业: 功能与智能高分子
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+20, 感谢！ 2014-03-21 11:13:22
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-03-21 16:28:35
感谢参与，应助指数 +1
wungung: 金币+20, 感谢！ 2014-03-21 11:13:22
月只蓝: 金币+3, 感谢指导！ 2014-03-21 16:28:35
|
应该是没有添加环境变量的原因： 进入自己使用账号的主目录，打开.bash_history或者.bashrc文件，在文件最后面添加GROMACS的路径 例如： export PATH=/usr/local/gromacs/bin:$PATH -------找到自己对应的安装目录，照这个格式改 保存后重新登录，应该就可以了。 |
6楼2014-03-20 21:20:26
10