| 查看: 3993 | 回复: 4 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
Crescendo铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
rDNA-ITS序列分析？ 已有1人参与
|
|
|
用了一对通用引物（18S，26S）扩增了某一虫子的rDNA-ITS，测序已获得1000bp左右片段。 求教：如何定义所测得的DNA序列中18S、ITS1、5.8S、TIS2和28S在所获得的序列的位置？如NCBI中相关截图所示 谢谢！  0.JPG |
回复此楼» 猜你喜欢
HILIC磁珠研究蛋白组学怎么做？
已经有0人回复
-
His标签蛋白纯化怎么才能快？
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有292人回复
-
WRN变构抑制剂HRO761：从D1/D2界面锁定到MSI合成致死的工具化合物深度解析
已经有0人回复
-
KRAS G12V(ON) 选择性抑制剂 RMC-5127：从三元复合物机制到科研应用
已经有0人回复
-
SHP2 变构抑制剂 Sitneprotafib：从作用机制到科研试剂选型要点
已经有0人回复
-
PRMT5·MTA 抑制剂 MRTX1719 的科研应用
已经有0人回复
-
SW033291 科研使用解析：分子特征、储存与实验获取要点
已经有0人回复
-
泛 RAS 抑制新思路：大环肽拟似物如何同时牵住突变型与野生型 RAS？
已经有0人回复
-
TYK2/JAK1 双靶点工具化合物 Brepocitinib：激酶选择性、研究进展与实验应用全解析
已经有0人回复
-
矢车菊素-3-O-葡萄糖苷质控实录：从一张HPLC图谱读懂纯度与稳定性
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于序列分析的问题
已经有5人回复
- ITS1/4序列进行blast同源比对问题
已经有4人回复
- 18s rDNA和ITS序列鉴定藻种的引物问题
已经有7人回复
- 真菌DNA提取测序的一些问题
已经有5人回复
- 细菌属种鉴定问题
已经有21人回复
- 如和鉴定一个扩增出的序列是不是全长序列？
已经有4人回复
- 真菌ITS鉴定问题若干
已经有8人回复
- 真菌18S，28S，ITS区段。
已经有14人回复
- 请问在GenBank上找到了一条序列，怎样知道作者所用引物的序列？
已经有9人回复
- 16S rRNA序列测定后如何查询菌的种属
已经有12人回复
- 土壤微生物16s rDNA 18s rDNA 抑制扩增不出来？？？？？？
已经有12人回复
- 鉴定细菌种（不是属）的生物学方法有哪些
已经有27人回复
- 现在需要将一个含有已知蛋白的菌给鉴定出来，写出两种方法
已经有4人回复
- 菌种生理生化特性
已经有3人回复
- 菌株16S rDNA同源性分析方法！！
已经有5人回复
- 做16S rDNA鉴定时进行同源性比较的方法！！
已经有18人回复
- 【求助/交流】ITS序列分析的通用引物，都有哪些？
已经有5人回复
- 【求助/交流】举例说明模式生物中一个基因的序列的获取、序列分析和功能分析
已经有8人回复
- 【求助/交流】核酸序列比对
已经有8人回复
- 【求助/交流】系统进化的分析
已经有10人回复
- 【求助/交流】已知基因序列如何克隆获得
已经有18人回复
- 【求助/交流】ITS测序
已经有17人回复
Crescendo
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 32 (小学生)
- 金币: 5824.6
- 散金: 152
- 红花: 15
- 帖子: 1312
- 在线: 375.9小时
- 虫号: 989569
- 注册: 2010-04-05
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
3楼2014-02-26 15:47:10
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Crescendo: 金币+5, ★★★很有帮助, 你的回复比较详细。但我有一点不清楚：5.8 S这段序列如何确定呢？ 2014-02-26 15:31:43
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-02-26 21:02:13
感谢参与，应助指数 +1
Crescendo: 金币+5, ★★★很有帮助, 你的回复比较详细。但我有一点不清楚：5.8 S这段序列如何确定呢？ 2014-02-26 15:31:43
kx444555: 金币+3, 鼓励交流 2014-02-26 21:02:13
 本帖仅楼主可见 |
2楼2014-02-26 14:27:49
yuren2009
木虫 (正式写手)
- 应助: 113 (高中生)
- 金币: 5670.8
- 散金: 96
- 红花: 3
- 帖子: 806
- 在线: 294.9小时
- 虫号: 2008028
- 注册: 2012-09-17
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
4楼2014-02-26 23:14:30
yuren2009
木虫 (正式写手)
- 应助: 113 (高中生)
- 金币: 5670.8
- 散金: 96
- 红花: 3
- 帖子: 806
- 在线: 294.9小时
- 虫号: 2008028
- 注册: 2012-09-17
- 性别: GG
- 专业: 植物病理学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
Crescendo: 金币+10, ★★★很有帮助, 最终我 是这样解决的：以同物种的18S,5.8S和28S为模板寻找自己测序的分离群体的对应位置。不过依照这样的方法，分析NCBI中其他近似物种，却并非绝对准确，这值得进一步确定。 2014-03-08 07:30:54
Crescendo: 金币+10, ★★★很有帮助, 最终我 是这样解决的：以同物种的18S,5.8S和28S为模板寻找自己测序的分离群体的对应位置。不过依照这样的方法，分析NCBI中其他近似物种，却并非绝对准确，这值得进一步确定。 2014-03-08 07:30:54
| 核糖体DNA中的18S、5.8S和28S的基因组序列在大多数生物中趋于保守,在生物种间变化小（异种同源性大），ITS1,ITS2为非编码区，相对变化较大。一段序列具体到各个基因位置我也不是很清楚，我的理解是：同个物种通过比较序列的保守性也就是通过序列比对或通过编码氨基酸与否确定位置（编码区和非编码区）。 |
5楼2014-02-28 23:19:19
