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Crescendo

铁杆木虫 (著名写手)

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[求助] rDNA-ITS序列分析？已有1人参与

用了一对通用引物（18S，26S）扩增了某一虫子的rDNA-ITS，测序已获得1000bp左右片段。
求教：如何定义所测得的DNA序列中18S、ITS1、5.8S、TIS2和28S在所获得的序列的位置？如NCBI中相关截图所示
谢谢！

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日拱一卒，功不唐捐

1楼2014-02-26 13:08:37

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引用回帖:

2楼: Originally posted by 周游1166 at 2014-02-26 14:27:49
18S是保守序列如果这个你标出来的菌和你是一个种或者属的话那么第15或者16到21这几个碱基是可以在你序列大概相同的位置找到找到后标记那么接下来的是ITS1序列。然后5.8S是保守序列找它前面几个碱基和最后面的 ...

主要不明白的是所谓的“保守序列”怎么确定？比如18S和5.8S保守区。

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日拱一卒，功不唐捐

3楼2014-02-26 15:47:10

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