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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 谁能提供一下gromacs形式的糖分子立场参数文件啊
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楼1970-01-01 08:00:00
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智能机器人

Robot (super robot)

我们都爱小木虫

找到一些相关的精华帖子，希望有用哦~

科研从小木虫开始，人人为我，我为人人

xiajiangrui

新虫 (初入文坛)
你好。我现在想找纤维二糖的GROMACS charmm的立场参数，应该怎么找呢？我刚刚接触
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4楼2017-05-04 17:15:27
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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
870277182: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-02-20 17:23:08
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-02-20 21:57:30
这里有：http://mackerell.umaryland.edu/CHARMM_ff_params.html
选择
CHARMM36 force field in Gromacs format
打开里面就有
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2楼2014-02-20 16:15:41
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870277182

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-02-20 16:15:41
这里有：http://mackerell.umaryland.edu/CHARMM_ff_params.html
选择
CHARMM36 force field in Gromacs format
打开里面就有

再请问一下，我打开了里边那个rtp文件，就是比较乱，每一种糖的参数我都得自己去里边找，因为PDB文件里糖环的名字必须得跟立场文件里的统一
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3楼2014-02-20 17:25:25
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