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870277182

铁虫 (小有名气)

[求助] 谁能提供一下gromacs形式的糖分子立场参数文件啊 已有1人参与

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jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
870277182: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2014-02-20 17:23:08
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流! 2014-02-20 21:57:30
这里有:http://mackerell.umaryland.edu/CHARMM_ff_params.html
选择
CHARMM36 force field in Gromacs format
打开里面就有
2楼2014-02-20 16:15:41
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870277182

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2014-02-20 16:15:41
这里有:http://mackerell.umaryland.edu/CHARMM_ff_params.html
选择
CHARMM36 force field in Gromacs format
打开里面就有

再请问一下,我打开了里边那个rtp文件,就是比较乱,每一种糖的参数我都得自己去里边找,因为PDB文件里糖环的名字必须得跟立场文件里的统一
3楼2014-02-20 17:25:25
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xiajiangrui

新虫 (初入文坛)

你好。我现在想找纤维二糖的GROMACS charmm的立场参数,应该怎么找呢?我刚刚接触
4楼2017-05-04 17:15:27
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