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zmclk

银虫 (小有名气)

[求助] 对未知功能基因的筛选 已有1人参与

我的实验材料是一种鞭毛虫 ochromonas, 发现其对一种多肽毒素有降解作用。为了研究其降解机制,我打算做一个转录组和表达谱。预计结果会有很多未知功能的基因产生显著性差异表达。那我该如何去筛选出与降解作用直接相关的未知基因呢?求各大神帮帮忙
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ysx0226

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

我是做植物转录组的,不知道虫子是不是一个道理
差异基因多少影响不大,先blast再Go分类,再pathway分析,根据这些看看哪些基因可能是你想要的,然后拿这些基因做功能验证什么的,就是这么思路吧
具体查下文献吧
2楼2014-01-11 16:40:26
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