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银虫 (小有名气)

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[求助] 对未知功能基因的筛选已有1人参与

我的实验材料是一种鞭毛虫 ochromonas，发现其对一种多肽毒素有降解作用。为了研究其降解机制，我打算做一个转录组和表达谱。预计结果会有很多未知功能的基因产生显著性差异表达。那我该如何去筛选出与降解作用直接相关的未知基因呢？求各大神帮帮忙

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1楼 2014-01-07 22:35:28

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ysx0226

金虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

我是做植物转录组的，不知道虫子是不是一个道理
差异基因多少影响不大，先blast再Go分类，再pathway分析，根据这些看看哪些基因可能是你想要的，然后拿这些基因做功能验证什么的，就是这么思路吧
具体查下文献吧

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